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Simonet, Michel

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Works: 41 works in 73 publications in 2 languages and 374 library holdings
Genres: Academic theses 
Roles: Thesis advisor, Author, Other, Lyricist, Opponent, Composer, Editor, Singer, Contributor
Publication Timeline
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Most widely held works by Michel Simonet
Bacterial pathogenesis : molecular and cellular mechanisms by Camille Locht( Book )

11 editions published in 2012 in English and held by 125 WorldCat member libraries worldwide

In this book, a group of distinguished scientists from eight different countries and three continents provide an overview of the molecular and cellular mechanisms of bacterial pathogenesis
Microbiologie générale : la bactérie et le monde bactérien by Henri Leclerc( Book )

6 editions published between 1994 and 1995 in French and held by 120 WorldCat member libraries worldwide

Une édition profondément remaniée pour tenir compte des acquis scientifiques de la dernière décennie. Dix chapitres : Le monde microbien - Morphologie et structure - Croissance et nutrition - Métabolisme - Information génétique - Mutations et transferts génétiques - Les grands groupes de bactéries - Le pouvoir pathogène - Les agents antimicrobiens. L'illustration et les tableaux sont adéquats. [SDM]
Bactériologie : bactéries des infections humaines by Patrick Berche( Book )

4 editions published between 1988 and 1991 in French and held by 66 WorldCat member libraries worldwide

Place de la structure génétique de l'espèce Escherichia coli dans l'état de son commensalisme intestinal et dans l'expression de sa virulence. by Mounira Smati( Book )

3 editions published in 2014 in French and held by 4 WorldCat member libraries worldwide

Escherichia coli est le commensal aérobie le plus fréquent du tube digestif de l'homme et des animaux à sang chaud et le bacille à Gram négatif pathogène opportuniste le plus souvent impliqué dans les infections intestinales et extra intestinales de l'homme. C'est une espèce clonale chez laquelle 4 groupes phylogénétiques principaux, A, B1, B2 et D ont été décrits. L'objectif de cette thèse est d'étudier l'adaptation de E. coli et les rapports de cette adaptation avec la structure génétique de l'espèce caractérisée par les 4 groupes phylogénétiques dans deux circonstances : le commensalisme intestinal de l'homme et de plusieurs espèces animales sauvages et domestiques, herbivores et omnivores d'une part et la virulence extra-intestinale mesurée par l'expression des gènes codants pour un sidérophore, la yersiniabactine, dont les gènes sont situés au sein de l'ilot de pathogénicité HPI (PAI IV). La répartition dans les 4 groupes phylogénétiques des souches commensales du tube digestif de 100 hommes et de 137 animaux a été étudiée par une technique de PCR en temps réel originale. Trois principaux entérocolitypes, correspondant à des associations préférentielles de phylogroupes ont été ainsi décrits comme plus fréquents en fonction de la nature des hôtes.Chez l'homme, les souches du groupe B2 ont été retrouvés exclusives chez 15 % des individus et ont été clairement distinctes des souches B2 des animaux sauvages par la plus grande fréquence de leurs facteurs de virulences (sfa/foc et pks). L'effet du fond génétique des sous groupes II, III et IX du groupe B2 sur l'expression de la virulence liée au HPI a été étudié dans un modèle murin de virulence extra-intestinale et dans un modèle d'amibe sociale Dictyostelium discoideum, pouvant être assimilé à un macrophage. Le HPI chez E. coli interagît avec la clonalité de l'espèce qui s'exprime par l'existence des sous-groupes de B2. Dans les modèles de virulence que nous avons développés, les mêmes gènes ont, en fonction du fond génétique des différents isolats naturels, des effets différents
Étude de l'épidémiologie des coliques du cheval à Saumur by Michel Simonet( Book )

5 editions published in 1979 in French and held by 4 WorldCat member libraries worldwide

Réponse immunitaire de la muqueuse intestinale à l'agression par Yersinia pseudotuberculosis by Rodrigue Dessein( Book )

2 editions published in 2008 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

REG3beta est une lectine de type C soluble qui joue un rôle dans l'immunité innée et la pathogenèse des maladies inflammatoires, mais son rôle exact reste mal compris. Dans cette thèse, nous décrivons une nouvelle fonction de cette protéine dans la régulation de l'inflammation et de la défense de l'hôte. Bien que l'expression de REG3beta est à la fois induite au cours d'une colite ou d'une infection entérique, son absence est associée à une baisse de l'élimination des bactéries et une augmentation des lésions inflammatoires de l'intestin. La libération de REG3beta est assujettie à la reconnaissance par TLR2 (mais pas par NOD2) de la flore commensale. Ainsi, nous avons constaté que cette protéine est essentielle dans la protection contre Yersinia pseudotuberculosis et ceux par l'engagement de la voie de signalisation dépendant de TLR2 (mais pas celle sous la dépendance de Nod2). REG3beta contribue à l'afflux de neutrophiles dans la muqueuse et est nécessaire pour optimiser l'expression d'un ensemble d'autres médiateurs de l'inflammation, dont RELMbeta (resistin-like molecule beta). Finalement, de par son implication dans la promotion de l'inflammation et la résolution d'une infection bactérienne, REG3beta est un pivot de la régulation de l'immunité intestinale dans le dialogue qu'entretiennent l'épithélium et la flore commensale
Intoxication chronique par le cadmium et sensibilité à l'infection expérimentale par Listeria monocytogènes by Michel Simonet( Book )

1 edition published in 1984 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Hydroxylapatite (HA) Powder for Autovaccination Against Canine Non Hodgkin's Lymphoma by Michel Simonet( )

1 edition published in 2013 in English and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Hydroxylapatite (HA) Powder for Autovaccination Against Canine Non Hodgkin's Lymphoma
Caractérisation génétique du locus uréase de Yersinia pestis et Yersinia pseudotuberculosis by Florent Sebbane( Book )

3 editions published between 2002 and 2013 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

L'uréase est une métallo-enzyme à nickel très répandue chez les procaryotes. Elle catalyse l'hydrolyse de l'urée en ions ammonium et carbamate. Sa biogénèse implique des gènes de structure dont les produits donnent naissance, après assemblage, à une enzyme inactive et des gènes auxiliaires qui codent des protéines activant l'apouréase par fixation de nickel. Yersinia pseudotuberculosis et Yersinia enterocolitica produisent une uréase dont la synthèse est régie par trois gènes de structure et quatre gènes auxiliaires orientés dans la même direction sur le chromosome. Yersinia pestis possède un locus ure homologue et nous avons démontré qu'il est très proche de celui de Y. pseudotuberculosis. Nous avons caractérisé l'environnement génétique en amont et en aval du locus ure de Y. pseudotuberculosis. Un opéron constitué de cinq gènes est présent et code untransporteur de nickel de type ABC. Le dernier gène du locus ure précède yut qui code un transporteur spécifique d'urée d'un nouveau type. Ce dernier est lui-même suivi de ureH qui spécifie un autre transporteur de nickel. Des gènes très fortement homologues à ynt, yut et ureH encadrent également le locus uréase de Y. pestis et Y. enterocolitica. Bien que Y. pestis soit pourvue du même équipement génétique que Y. pseudotuberculosis, cette bactérie n'est pas uréolytique. Nous avons montré que ce phénotype résulte d'une mutation ponctuelle dans ureD, à l'origine d'une protéine ureD tronquée qui est dépourvue d'activité biologique
Growth of Yersinia pseudotuberculosis in human plasma: impacts on virulence and metabolic gene expression by Marie-Laure Rosso( )

1 edition published in 2008 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

ACTIVITE DES PEPTIDES ANTIMICROBIENS SUR YERSINIA ENTEROCOLITICA ET YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS by CORINNE SIAKA TAGNY( Book )

1 edition published in 1996 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

ACTIVITE BACTERICIDE COMPAREE DE SIX MACROLIDES ET DE L'AMOXICILLINE ASSOCIEE A L'ACIDE CLAVULANIQUE SUR HAEMOPHILUS INFLUENZAE by Stéphanie Bordes-Couecou( Book )

1 edition published in 1995 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Systèmes à deux composants et virulence de Yersinia pseudotuberculosis by Claire Flamez( Book )

2 editions published in 2007 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Yersinia pseudotuberculosis est une bactérie qui colonise de multiples écosystèmes, notamment l'intestin (jonction iléo-caecale) de l'homme et de nombreux animaux, dans lequel elle induit des lésions. Son adaptation très rapide, face à un environnement changeant et le plus souvent hostile, est cruciale pour sa survie. À cette fin, différentes voies permettent aux bactéries d'interagir avec des signaux extérieurs. L'une des plus efficaces met en jeu des systèmes à deux composants. Le prototype est constitué d'une histidine kinase membranaire percevant des variations environnementales, qui est couplée à un régulateur de réponse cytoplasmique capable d'intervenir sur la transcription d'un ensemble de gènes cibles dénommé régulon. Après perception du stimulus, le capteur s'autophosphoryle et transfère ensuite le groupement phosphate vers le régulateur de réponse associé. Cette réaction induit une réponse cellulaire : deux protéines bactériennes créent donc un circuit assurant la conversion d'un signal extérieur de danger en une transcription génique adaptée. L'analyse in silico du génome de Y. pseudotuberculosis a révélé la présence de vingt-quatre systèmes de régulation à deux composants ainsi que d'un capteur et de trois régulateurs orphelins, c'est-à-dire sans partenaire. Après inactivation, par génétique inverse, de chacun des régulateurs de réponse, nous avons entrepris de déterminer la capacité des vingt-sept mutants obtenus à survivre in vitro face à des stress rencontrés par la bactérie dans le tube digestif. Dix présentent un niveau de résistance à un pH acide et / ou à une pression osmotique élevée, un stress oxydatif, la présence de bile ou de peptides anti-microbiens différent de la souche sauvage. Toutefois, seuls quatre sont moins virulents per os pour la souris : phoP, rstA-like, yfhA-like et surtout ompR. Dans les limites de nos modèles d'étude, un nombre restreint de système à deux composants semble donc contrôler la virulence de Y. pseudotuberculosis. La caractérisation de leur régulon devrait mettre au jour des gènes impliqués dans le pouvoir pathogène bactérien méconnus jusqu'à présent
Identification et caractérisation fonctionnelle et structurale du système toxine-antitoxine HicA3-HicB3 de Yersinia pestis by Sabrina Bibi-Triki( Book )

2 editions published in 2014 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Toxin-antitoxin systems (TAS) are generally constituted by two small cytoplasmic proteins: a stable toxin and an unstable antitoxin which neutralizes the toxin and represses the expression of the toxin-antitoxin operon. In previous research, our lab found that Yersinia pestis lacking the hicB3 (ypo3369) gene, encoding a putative orphan antitoxin, has a growth defect in vitro and is attenuated for virulence in a murine model of bubonic plague (Pradel et al., 2014). In silico analysis revealed a small gene upstream of hicB3, encoding a putative toxin that we called HicA3. HicA3 overproduction generates bacteriostasis of Escherichia coli and Y. pestis, and the subsequent production of HicB3 restores cell growth. HicA3 and HicB3 thus constitute a functional TAS. However, the lack of the HicA3B3 TAS does not affect Y. pestis virulence in a murine model of bubonic plague. We then purified and characterized the HicA3 and HicB3 proteins. The HicA3 toxin is a monomeric 66-aa ribonuclease with a catalytic histidine residue required for its activity. The HicB3 antitoxin has two functions: it binds and neutralizes HicA3 and it represses the hicA3B3 operon promoter. Gel-shift assays and transcriptional reporter fusion experiments showed that both HicB3 and the HicA3-HicB3 complex bind to two operators overlapping the -10 and -35 boxes of the PhicA3 promoter. We also solved the crystal structures of the HicB3 antitoxin and the HicA3-HicB3 complex. HicB3 is a tetramer with two DNA binding domains of the ribbon-helix-helix type and two toxin neutralization domains
Induction par un stress de la résistance aux peptides antimicrobiens chez Yersinia by Sonia Arafah( Book )

2 editions published in 2009 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Lorsque les bactéries colonisent un hôte, elles sont rapidement confrontées à l'activité d'effecteurs de l'immunité innée parmi lesquels figurent les peptides anti-microbiens. Produites par de nombreux organismes vivants, ces molécules sont pourvues de charges électro-positives et de domaines hydrophobes responsables de leur activité : leurs interactions avec les charges électro-négatives portées par des composés de la surface bactérienne est suivie d'une perméabilisation de la membrane cytoplasmique susceptible d'aboutir à la mort cellulaire. Cependant, au cours de leur évolution, les bactéries ont développé des mécanismes défensifs à l'égard des peptides anti-microbiens. Ainsi, lorsque Yersinia pseudotuberculosis - une bactérie pathogène pour le tractus digestif de l'homme et de nombreux animaux et choisie comme modèle pour cette étude- a poussé dans un milieu carencé en fer, sa survie est augmentée en présence d'un peptide anti-microbien particulier : la polymyxine B. A l'opposé, celle de Y. enterocolitica, une espèce phylogénétiquement proche, reste inchangée dans les mêmes conditions expérimentales. Nous avons donc émis l'hypothèse que des gènes, présents uniquement chez Y. pseudotuberculosis, conféreraient au microorganisme la capacité de résister à la polymyxine B. Afin de les caractériser, nous avons construit une banque constituée de dix mille fragments génomiques (obtenus aléatoirement) de Y. pseudotuberculosis, puis recherché le(s)quel(s) d'entre eux permet(tent) l'induction d'une résistance à la polymyxine B chez Y. enterocolitica privée de fer. Nous avons ainsi identifié deux régions chromosomiques distinctes de Y. pseudotuberculosis qui sont impliquées dans le phénotype de résistance. La première comporte trois gènes, YPTB0331, YPTB0332 et YPTB0333, spécifiant respectivement un transporteur putatif, une protéine de fonction inconnue et un régulateur transcriptionnel de la famille LysR. La seconde région comprend deux gènes, YPTB2685 et YPTB2686, codant des produits de fonction inconnue. L'inactivation de l'un des gènes de chacune de ces régions, YPTB0333 et YPTB2686, altère la résistance de Y. pseudotuberculosis à la polymyxine B mais également à des peptides anti-microbiens d'Invertébrés (dérivés de cécropines, polyphémusine). Elle est également associée à une diminution de la virulence bactérienne in vivo, qui est essentiellement due à une colonisation réduite des plaques de Peyer intestinales, étape déterminante du processus infectieux chez l'hôte. Le mécanisme de résistance mis en jeu par YPTB0331-0332-0333 est une modification de la surface bactérienne, responsable d'une réduction du contact des peptides avec la bactérie. Le rôle exercé par YPTB2685 et YPTB2686 serait d'inactiver (voire de dégrader) la polymyxine B
Les F-classes : classes d'équivalence induites par les dépendances inter-attributs dans les familles d'objets by Ana Simonet( Book )

1 edition published in 1989 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Il est parti seul( Recording )

in Undetermined and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

YAPI, un nouvel îlot de pathogénicité des Yersinia entéropathogènes by François Collyn( Book )

2 editions published in 2004 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les îlots génomiques bactériens sont des éléments génétiques transmis latéralement entre microorganismes phylogénétiquement distants. Leur origine exogène est notamment illustrée par un contenu en guanine et cytosine (GC% ou coefficient de Chargaff) et un usage des codons différents de ceux du chromosome ainsi que par la présence de gènes impliqués dans la mobilisation de l'ADN. Parmi les îlots génomiques, les îlots de pathogénicité transportent plus particulièrement des gènes de virulence, dont la dissémination favorise l'émergence de nouvelles espèces pathogènes. Bien que certains îlots aient été identifiés chez des espèces éloignées, il n'a jamais été possible d'orienter et de reconstituer leur transfert. Nous avons mis à jour chez Yersinia pseudotuberculosis, une bactérie à Gram négatif responsable d'infections digestives, une nouvelle adhésine fimbriale impliquée dans sa virulence. Ces pili, dits de type IV, sont synthétisés grâce à un opéron de 11 gènes pil, qui n'est présent que chez 40% des souches de l'espèce et possède un GC% plus élevé que le reste u chromosome. Le séquençage des régions flanquant l'opéron pil a révélé que ces gènes portés par un nouvel îlot de pathogénicité de 98 Kilobases. Dénommé YAPI pour Yersinia Adhesion Pathogenicity Island, il ne porte pas d'autres gènes de virulence que ceux codant les pili de type IV. La découverte d'un îlot apparenté chez Y. enterocolitica et Salmonella enterica, deux autres espèces entéropathogènes, indiquait que ces bactéries se seraient transmises le même élément au cours de l'évolution. Grâce à l'utilisation des propriétés génomiques de ces bactéries nous avons pu identifier le plasmide à l'origine de ces îlots de pathogénicité et démonter que S. enterica l'avait transféré au genre Yersinia, avant sa spéciation
 
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Bacterial pathogenesis : molecular and cellular mechanisms
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