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Cuny, Philippe (19-....; professeur des universités)

Overview
Works: 16 works in 25 publications in 2 languages and 29 library holdings
Roles: Other, Thesis advisor, Author, Opponent
Classifications: QH541.5.W3, 550
Publication Timeline
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Most widely held works by Philippe Cuny
Evidence for surfactant production by the haloarchaeon Haloferax sp. MSNC14 in hydrocarbon-containing media by Ikram Djeridi( )

1 edition published in 2013 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Degradation of terrestrial particulate organic matter discharged by rivers in the Mediterranean Sea : processes, interactions and global impacts by Marie-Aimée Galeron( )

2 editions published in 2016 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

The degradation of terrestrial organic matter has puzzled scientists for decades. Once thought to be refractory to further degradation once at sea, it was finally shown that very little trace of a terrestrial signature was found in coastal sediments.In order to fully apprehend these degradation processes, it is crucial that we look at their global occurrence, and try to determine if the same pattern is observed in temperate areas.Using a set of lipid tracers especially designed to help us trace both the origin of the particulate organic matter and the degradative processes it had undergone, all samples collected in the Rhône river were analyzed and compared with Arctic and Tropical samples. The roles of photo- and autoxidation during riverine transport were clearly evidenced: photo-oxidation was the main degradation driver in the Mackenzie River, while autoxidation had a clearly more important role in the Amazon River. In the Rhône River, both processes had a moderate impact on riverine suspended particulate matter (SPM), but yet, an intense autoxidation was evidence in the Rhône plume, just as it was evidenced in the Mackenzie plume.Further analyses on the collected samples allowed us to formulate - and confirm - a new hypothesis. A lipoxygenase enzymatic activity was observed and quantified in all the samples studied, at various degrees depending of local conditions. This activity was shown to be induced by the variable amounts of autoxidation- or photo-oxidation deriving hydroperoxides present in the suspended particulate matter, highest at high and low latitudes
Lien entre la diversité microbienne, la stabilité des communautés microbiennes et le turnover des matières organiques du sol by Vincent Tardy( Book )

2 editions published in 2014 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les communautés microbiennes sont des acteurs majeurs du fonctionnement biologique du sol à travers notamment leur implication dans les transformations des cycles biogéochimiques (C, N, P...). Dans les agro-écosystèmes, la diversité de ces communautés est régulièrement modifiée par des perturbations liées aux pratiques agricoles et la question des conséquences de ces modifications pour le maintien du fonctionnement biologique et des fonctionnalités des systèmes agricoles est aujourd'hui centrale. Si le rôle de la diversité biologique pour le fonctionnement des écosystèmes a été bien étudié chez les macro-organismes, et notamment les plantes ; la relation biodiversité/activité est encore très mal connue pour les microorganismes du sol. Pourtant, dans la mouvance agroécologique actuelle, cette connaissance est nécessaire pour définir de nouvelles pratiques culturales intégrant une gestion de la diversité microbienne pour une utilisation durable des agrosystèmes. Dans ce travail, l'objectif général était de tester l'importance de la diversité pour la stabilité (résistance/résilience) et l'activité des communautés microbiennes (bactéries et champignons) impliquées dans les transformations de la matière organique dans le sol, une fonction déterminante pour la fertilité des sols, la qualité de l'environnement et les changements globaux. D'un point de vue expérimental, nos questions ont été abordées par le couplage d'expérimentations au laboratoire avec des échantillonnages réalisés au terrain. Dans un premier travail basé sur une manipulation de la diversité au laboratoire, nous avons montré que la stabilité de la structure et de l'activité des communautés en réponse à différentes perturbations est positivement liée à la diversité microbienne (i.e. nombre d'espèces). Ce lien a ensuite été validé par une expérimentation basée sur un échantillonnage de terrain qui nous a permis de démontrer (i) que la diversité microbiennes peut être modulée (augmentée ou diminuée) en fonction de l'intensité d'usage des sols, et (ii) que la minéralisation de la matière organique est plus intense dans les sols présentant les plus hauts niveaux de diversité. Enfin, dans le cadre d'une expérimentation réalisée au terrain (SOERE-ACBB, Lusignan), nous avons montré que la réponse des communautés de bactéries et de champignons à un apport de résidus de blé, en termes de successions de populations et d'activité de minéralisation de la matière organique, dépend de l'historique cultural du sol. Ces travaux apportent de nouvelles connaissances sur l'importance de la diversité microbienne (richesse, composition) pour la stabilité et l'activité des communautés impliquées dans les transformations de la matière organique dans le sol. Ils montrent également que la modulation de la diversité des communautés microbiennes du sol par les pratiques agricoles, présentes ou passées, peut affecter significativement le turnover de la MOS
Biodégradation des hydrocarbures en milieux sursalés by Yannick Corsellis( )

2 editions published in 2017 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Ce travail a permis d'étudier la dynamique saisonnière des communautés microbiennes (cytométrie en flux et MiSeq ADNr16S) d'un étang sursalé thalassohalin. Malgré les variations de salinité (15,5 à 32 %), un core microbiome hautement stable (97,2± 2,1%) et dominé par Haloquadratum (40,3 à 57,4%) et Salinibacter (4,9 à 21,8%) a été décrit. De plus, des populations halotolérantes, capables de croitre rapidement, ont été détectées durant les épisodes de dilution des eaux. Dans un contexte physico-chimique contraignant où la biodégradation des hydrocarbures (HC) reste controversée, une première étude a été réalisée afin de comprendre le devenir d'un pétrole et son effet sur les communautés microbiennes actives de saumures proches de la saturation en sels (31%). Après biostimulation de ces communautés par l'ajout de matière organique labile et d'une température favorable (40°C), des phytolyptes actifs appartenant aux genres Haloarcula, Halobacterium et Halorubrum ont été détectés dans les microcosmes présentant de la biodégradation (12,8%) après 30 jours. Face aux limitations des processus d'autoépuration en contexte naturel (température plus faible), plusieurs approches de biostimulation testées (i.e. fertilisation minérale -NS ou organique -DS ; dilution) ont permis de forts taux d'atténuation des HC aliphatiques (97,8% et 54,5%) dans des saumures diluées (27,7 à 14%) et fertilisées (-DS et -NS). Dans ces mêmes microcosmes, des phylotypes actifs majoritaires appartenant aux genres Marinobacter et à la famille des Flavobacteriaceae (dont Psychroflexus) ont été détectés (MiSeq ADNr16S). L'opérabilité de ces traitements mériterait d'être testée à une plus large échelle
Devenir d'une contamination pétrolière dans des sédiments côtiers infralittoraux et son impact sur les communautés bactériennes by Gilles Miralles( Book )

2 editions published between 2007 and 2013 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Fossil fuels, such as petroleum, are one of our most important natural resources, the major energy source of our industrial society and the basis of feedstock for the petrochemical industry. Nevertheless, petroleum is also one of the most organic pollutants. Episodic and chronic pollution of the marine environment by crude oil or distillate fractions cause major ecological perturbations. Fortunately, a substantial proportion of the oil entering marine habitats can be degraded by indigenous microorganisms, called hydrocarbonoclastic microorganisms. Despite there being a considerable amount of literature on microbial hydrocarbon degradation, until recently we had limited knowledge about the behaviour of bacterial communities in contaminated environments and their interactions with hydrocarbons in situ. To date, studies of bacterial dynamics have essentially focused on aerobic waters and shoreline systems. However, a large part of the spilled oil (20 30%) can sediment and can be deposited on bottom sediments where oxygen penetration does not exceed the first 2 3 millimetres, such as infralittoral sediments. The present study reports on the fate of oil spills and their effects on bacterial communities in infralittoral coastal sediments. A field experiment of artificial oil spill, conducted at 20 m water depth, was undertaken. Analysis of oil composition revealed that aliphatic hydrocarbons were degraded under in situ conditions. Alkanes with shorter chain lengths were degraded faster than longer chain alkanes. Furthermore, in situ degradation under strictly anaerobic conditions (8 10 cm sediment depth) was formerly proven. Also, we have shown that the community's response to oiling is a complex phenomenon. At the three depths studied (0 1, 2 4 and 8 10 cm), bacteria implicated in the main changes in the structure of bacterial communities were affiliated to hydrocarbonoclastic sulfate reducing bacteria (SRB) (e.g. strains Hxd3, Pnd3, AK01, Desulfatibacillum aliphaticivorans CV2803T and D. alkenivorans PF2803T). Detection of specific metabolites of anaerobic n alkane degradation pathways of strain AK01 and D. aliphaticivorans CV2803T indicated that these bacteria contributed to the biodegradation of n alkanes. Also, vertical heterogeneity of the bacterial communities within the sediment was more pronounced in the oiled sediments than in control sediments. The development of the vertical heterogeneity could result from stratification of different populations in the oiled sediments, favored by bioturbation. In fact, during an experiment under laboratory conditions, we have shown that the presence of the marine polychaetes Nereis diversicolor affects bacterial communities in contaminated sediments but do not affect the communities in control sediments. Bioturbation activities by N. diversicolor may, among other things, enhance sediment oxygenation and hydrocarbon bioavailability. Thus, it may favour the development of specific bacterial groups, not present in the contaminated but non bioturbed sediments. Some of these bacteria play a critical role in bioremediation processes (e.g. Alcanivorax sp. OM 2, Psychroserpens burtonensis). This study provides useful information on microbial ecology in anthropised marine ecosystems. Under in situ conditions, the behaviour of microbial communities is determined by a myriad of parameters.regarding these results, it remains essential not to focus only on hydrocarbon degraders but to study the whole communities and their interactions with the sedimentary ecosystem
Diversité des intégrons dans des sédiments estuariens anthropisés. by Cynthia Oliveira( )

2 editions published in 2017 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les intégrons sont des plateformes génétiques bactériennes de capture et d'expression de gènes. Les intégrons cliniques sont les principaux responsables de la forte augmentation récente des bactéries multirésistantes aux antibiotiques. Cependant, dans l'environnement, ils ne représentent qu'une part minime de l'importante diversité des intégrons. Ainsi, les objectifs de cette thèse étaient (i) d'évaluer l'étendue de la diversité des intégrons dans l'environnement, (ii) de comprendre les phénomènes responsables de la structuration du pool d'intégrons dans le compartiment sédimentaire d'un milieu estuarien anthropisé et (iii) de rechercher l'existence potentielle d'intégrons indicateurs du niveau de contamination chimique.Le suivi des intégrons de classes 1, 2 et 3 et des populations d'E. coli dans des sédiments du bassin versant de la Risle impactés par des sources de contamination fécale bien caractérisées ont montré qu'en étiage, les souches d'E. coli d'origine humaine se disséminaient sur de courtes distances. Les intégrons de classe 1 se disséminent sur des distances un peu plus importantes et se maintiennent dans les 12 premiers centimètres du compartiment sédimentaire au moins.Une méthode a été développée permettant, pour la première fois, l'analyse de la diversité des intégrons via séquençage haut-débit. L'application de cette méthode sur une carotte sédimentaire de 4,8 m de profondeur prélevée dans l'estuaire fluvial de la Seine a permis de mettre en évidence plusieurs milliers de classes d'intégrons dont de nombreuses intégrases encore jamais répertoriées. La diversité des intégrons chute fortement avec la profondeur. Les intégrons de classe 1, majoritaires dans les sédiments de surface, ont une abondance qui chute fortement avec la profondeur cependant ils répondent plutôt positivement à la contamination chimique renforçant l'idée de leur utilisation comme proxy de pollutions anthropiques récentes. Trois classes d'intégrons dominent dans la vase consolidée représentant 38% des séquences obtenues dans la carotte sédimentaire mais répondant plutôt négativement à la contamination chimique. Enfin, la structure du pool d'intégrons est fortement corrélée à celle de la communauté bactérienne mais semble en partie indépendante de la communauté bactérienne dans deux des fractions sédimentaires profondes avec la dominance d'une nouvelle classe d'intégrons qui semble sélectionnée par les HAP
Biodégradation des Hydrocarbures en milieux hypersalins : modes de transferts et réponses des communautés procaryotiques à une contamination pétrolière. by Ikram Djeridi( Book )

2 editions published in 2013 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Le devenir des hydrocarbures (HC) dans les environnements hypersalins constitue une problématique environnementale majeure. Ce travail pour objectifs (1) d'évaluer l'impact d'une pollution pétrolière sur les communautés microbiennes d'un milieu hypersalin, (2) de déterminer comment les archées hydrocarbonoclastes accèdent aux HC et, (3) de déterminer si la biodégradation est possible en conditions anaérobies dans ces environnements hypersalés. Nous avons démontré qu'une biodégradation modérée du pétrole est possible en milieu hypersalin environ 10 % de la fraction aliphatique du pétrole sont biodégradé. Une disparition progressive des composés aromatiques les plus légers est également observée, liée aux processus abiotiques. La dynamique des communautés procaryotiques montre un changement dans la structure de la communauté bactérienne autochtone des saumures. Une résistance à la contamination pétrolière a en revanche été observée pour les communautés archéennes des saumures. Dans une deuxième partie du travail, nous avons pu montrer, à l'aide d'une souche d'archée hyperhalophile modèle (Haloferax volcanii MSCN14), que les archées hydrocarbonoclastes de ces environnements mettent en oeuvre plusieurs mécanismes leur permettant d'augmenter la biodisponibilité des HC. Dans une dernière partie des travaux, nous avons testé les capacités d'une souche modèle (Hfx. volcanii MSNC 16) à dégrader les HC en anaérobiose. Si Hfx. volcanii MSNC16 est bien capable d'utiliser le fumarate comme accepteur terminal d'électrons, elle n'est en revanche pas capable de dégrader l'alcane testé (heptadécane) en absence d'oxygène
Etude des processus de photodégradation des chlorophylles à chaîne phytyle dans le milieu marin à l'aide de marqueurs isoprénoïdes by Philippe Cuny( Book )

2 editions published in 1997 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Des etudes recentes ont montre que la photo-oxydation de la chaine phytyle de la chlorophylle aboutissait a la formation de deux photoproduits isoprenoides acycliques majoritaires : la 6,10,14-trimethylpentadecan-2-one (phytone) et le 3-methylidene-7,11,15-trimethylhexadecan-1,2-diol (phytyldiol), susceptibles d'etre utilises comme marqueurs de ce processus. Ce travail de recherche porte sur l'utilisation potentielle de ces composes dans l'etude in situ du processus de photodegradation des chlorophylles a chaine phytyle. Les resultats obtenus montrent que le phytyldiol est un bon marqueur de ce processus, il est, en effet, specifique, relativement stable et largement repandu dans les ecosystemes marins. La phytone est majoritairement issue de la photodegradation de la chaine phytyle de la chlorophylle, mais son manque de specificite ainsi que son manque de stabilite dans les sediments restreint son utilisation comme marqueur. Nous proposons l'utilisation de l'indice de photodegradation de la chaine phytyle de la chlorophylle (chlorophyll phytyl side chain photodegradation index ou c.p.p.i. : rapport molaire du phytyldiol sur phytol) pour l'etude in situ du processus de photodegradation de la chlorophylle ; l'utilisation de cet indice repose sur la determination experimentale, a partir de souches d'algues representatives des communautes phytoplanctoniques marines, d'un modele mathematique permettant de relier le c.p.p.i. A la quantite globale de chlorophylle photodegradee. Les mesures de c.p.p.i. Effectuees sur des echantillons provenant de nombreuses zones marines, aussi bien cotieres qu'oceaniques, ont permis de montrer qu'au moins 10 a 20% de la chlorophylle detritique etait photodegradee dans la couche photique des oceans. Dans certaines zones, plus de 50% voire 90% des pigments chlorophylliens peuvent etre degrades par la lumiere, c'est le cas dans des zones oligotrophes telles que la mediterranee nord-occidentale
Dynamique des hydrocarbures dissous dans les eaux côtières : applications en Méditerranée et à l'écosystème récifo-lagonaire de la Réunion, Océan Indien by Catherine Guigue( )

2 editions published in 2017 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

This PhD aimed to improve the knowledge about aliphatic and aromatic polycyclic hydrocarbon (AHs and PAHs, respectively) dynamics in coastal waters subjected to various anthropogenic pressures (domestic, urban, agricultural, industrial). This work was performed in 1) Rhône-Fos-Marseille area (RFM, Northwestern Mediterranean Sea), 2) surface coastal waters of the Gulf of Gabès (Tunisia, Southern Mediterranean Sea) and 3) a coral reef ecosystem (La Réunion Island, Indian Ocean). Finally, we followed the remobilization of PAHs and organic matter (OM) in seawater during resuspension experiments of sediment from Toulon Bay (France). The concentrations, in dissolved AHs and PAHs, show important spatial and seasonal variability. They are considered as moderate to high, and remain below the toxicity thresholds except during sediment resuspension situations. The study of AHs shows the superposition of anthropogenic and biogenic origin signatures while that of PAHs mirrors rather the dominance of anthropogenic petrogenic inputs compared to pyrogenic ones. Our results suggest also the biogenic marine origin of PAHs. These studies made it possible to highlight the role of atmospheric inputs and that of freshwaters (rivers or effluents) as well as the spatial and seasonal variability of processes such as air-sea exchanges or bio, photo-degradation/transformation, on the distribution of these two hydrocarbon classes. Finally, the present work shows the need to improve the knowledge on the role of organic matter quality on the toxicity of PAHs for marine organisms in coastal waters
Activité hydrocarbonoclaste de procaryotes dans des milieux extrêmes (hyperbares et hypersalés) by Yosmina Héléna Tapilatu( Book )

2 editions published in 2010 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Bien que les travaux portant sur la biodégradation des hydrocarbures soient bien documentés, très peu d'études ont toutefois été effectuées dans les milieux de vie extrême. A ce jour, la plupart des études portant sur le devenir des hydrocarbures et le rôle joué par les micro-organismes hydrocarbonoclastes dans leur biodégradation ont été conduites dans des milieux presentant principalement des conditions physico-chimiques standards (e.g. pression hydrostatique de 0,1 MPa, salinité comprise entre 0 et 39 g L-1). Or, une partie importante des hydrocarbures déversés dans l'environnement peut aussi contaminer les milieux océaniques profonds (pression hydrostatique supérieure à 10 MPa) ainsi que les milieux hypersalés côtiers (salinité supérieure à 150 g L-1). Par ailleurs, le traitement des rejets hypersalins contaminés par les hydrocarbures qui sont générés par les exploitations pétrolières posent des problèmes sérieux et couteux. Ce travail de recherche porte sur l'étude de l'activité hydrocarbonoclaste de procaryotes présents dans des milieux extrêmes (hyperbares et hypersalés) pour d'une part, comprendre les processus naturels de biodégradation dans ces écosystèmes et d'autre part permettre le développement futur de techniques de réhabilitation spécifiques. Dans ce but, des expérimentations en laboratoire ont été réalisées. Une mise au point de méthodes d'incubation sous pression hydrostatique nous a permis d'obtenir des informations métaboliques et physiologiques importantes sur une souche bactérienne piézotolérante hydrocarbonoclaste (Marinobacter hydrocarbonoclasticus #5) lorsqu'elle se développe sous pression hydrostatique (35 MPa) sur hexadécane comme seule source de carbone et d'énergie. Cela confirme la capacité de certaines bactéries à dégrader les hydrocarbures en conditions hyperbares. Les résultats obtenus soulignent par ailleurs l'importance de la synthèse de cires dans le fonctionnement énergétique des souches hydrocarbonoclastes et soulèvent de nombreuses questions quant à l'augmentation du degré d'insaturation des acides gras cellulaires à pression hydrostatique élevée. D'une manière intéressante, nos résultats montrent aussi que les micro-organismes qui jouent potentiellement un rôle important dans la biodégradation des hydrocarbures dans les milieux océaniques profonds méditerranéens appartiennent aux mêmes genres que ceux isolés des milieux côtiers, notamment Alcanivorax. Notons également que dans les conditions de culture utilisées certaines souches isolées dégradent préférentiellement le n-hexadecane (e.g. Alcanivorax venustensis, Rhodobacter) ou l'heptadecane (e.g. Marinobacter sp.). De même, les archées halophiles extrêmes hydorcarbonoclastes que nous avons isolées appartiennent aux deux genres ubiquistes des environnements hypersalés que sont Haloarcula et Haloferax. En fonction des souches, les archées halophiles isolées montrent un taux important de dégradation de 32 à 95% (0.5 g L-1) du n-heptadécane après 30 jours d'incubation à 40°C dans les milieux sursalés synthétiques (225 g L-1 NaCl). Certaines souches comme Haloferax sp. MSNC 14 sont capables de dégrader à la fois des n-alcanes et un hydrocarbure aromatique polycyclique (HAP), le phénanthrène. Les résultats obtenus au cours de ce travail de thèse constituent une contribution à l'amélioration de nos connaissances sur le devenir des hydrocarbures dans les milieux océaniques profonds et les milieux hypersalins, jusqu'alors peu étudiés. Au regard de ces résultats, il apparaît indispensable de poursuivre l'étude des milieux extrêmes et de la biodiversité microbienne unique qu'ils abritent. Mots clés : hydrocarbures, biodégradation, souches hydrocarbonoclastes, milieux extrêmes, pression hydrostatique, salinité
Apport du bloc parasacral dans l'analgésie pour arthroplastie totale de hanche : étude des pratiques au CHU de Caen by Philippe Cuny( Book )

1 edition published in 2005 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Spatial oxygen heterogeneity in a Hediste diversicolor irrigated burrow by Laura Pischedda( )

1 edition published in 2011 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Substrates specialization in lipid compounds and hydrocarbons of Marinobacter genus by Patricia Bonin( )

1 edition published in 2014 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Effets de perturbations naturelles ou anthropiques sur la structure et la dynamique d'un réseau trophique : approche par modélisation by Benjamin Girardot( )

1 edition published in 2021 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Habituellement, les relations entre, d'une part, la fragilité des réseaux trophiques et leur structure, et d'autre part, les processus génératifs responsables de ces structures, sont traitées de façon distincte. On développe dans cette thèse un modèle d'assemblage éco-évolutif qui permet d'étudier ces deux relations dans un cadre unifié. Pour chacune d'entre elles, trois niveaux d'organisation sont considérés: le réseau, le motif (*c.à.d* des triplets d'espèces des réseaux), et l'espèce. On étudie le rôle de l'histoire évolutive des communautés dans la mise en place de ces structures, ainsi que leur fragilité. On met tout d'abord en avant un rôle clé de la richesse environnementale d'évolution sur les structures émergentes des réseaux trophiques et leurs fragilités associées. On montre aussi que cette richesse environnementale d'évolution joue un rôle important dans le type de contrôles ("bottom-up" *vs* "top-down") présents dans les communautés. On met ensuite en évidence des sous-structures des réseaux particulièrement fragiles ; sous-structures qui permettent, associées à d'autres indicateurs à l'échelle des espèces, de renforcer les prédictions quant à la fragilité de ces espèces. On étudie enfin l'émergence de la distribution caractéristique de ces sous-structures ,ou motifs de réseaux: bien que de schémas communs sont observés, par exemple dans l'ordre d'apparition, ou de "fixation", de certains décès motifs, on montre que la vitesse d'émergence semblent dépendre des conditions abiotiques d'évolution
Conception de biocathode et implication du fer dans de nouveaux modes de transfert d'électrons by Nicolas Chabert( )

1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les piles à combustible microbiennes (PCMs) sont une technologie convertissant l'énergie chimique stockée dans la matière organique en énergie électrique à l'anode à l'aide de bactéries dites électroactives. A l'inverse des bioanodes, l'intérêt porté aux cathodes biologiques dans les PCMs est récent et ces dernières sont encore peu étudiées. Les objectifs de ces recherches ont donc été d'identifier et de décrire des bactéries ainsi que les mécanismes permettant de catalyser une réduction cathodique notamment celle de l'oxygène. La première partie des travaux portant sur la réalisation d'un criblage pour la formation de biocathodes a révélé l'inefficacité du métabolisme hétérotrophe pour la conception de biocathodes performantes. De ce fait, la suite des travaux a porté sur la bactérie chimiolithoautotrophe acidophile Acidithiobacillus ferrooxidans. Deux mécanismes de transfert d'électrons dépendant du fer ont été mis en évidence générant un courant maximal de -3,8 A.m-2. Nous avons également abordé les mécanismes de transfert d'électrons en milieu neutre chez une bactérie hétérotrophe, Pseudomonas brassicacearum NFM421 bien que peu performante en terme de production de courant. Cette dernière permet une catalyse indirecte de la réduction de l'oxygène à la cathode à pH neutre via un métabolite secondaire le 2,4-diacéthylphloroglucinol associé au fer, mettant encore une fois en lumière l'importance du fer dans le transfert d'électrons. Ce travail a également porté sur la potentielle application des biopiles dans des environnements anthropisés en vue de l'extraction de métaux et plus particulièrement de terre rares qui s'avèrent être une voie de recherche prometteuse
Méthodes, procédures et techniques hyperbares pour l'étude des microorganismes du milieu profond en condition in situ by Marc Garel( )

1 edition published in 2021 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

The ocean is deep, with the majority of its volume (>80%) at depths greater than 1000 m, and is poorly sampled (<0.01%). It is characterized by high hydrostatic pressure, low temperature, high inorganic nutrients and low organic carbon concentrations. Substrate input is primarily from primary production in the form of particulate and dissolved organic matter. The particulate and dissolved labile fractions are mainly consumed in surface waters by prokaryotes, leaving only a so-called refractory fraction as the only carbon source for prokaryotes in the bathypelagic zone. Most measurements of metabolic activity and diversity of bathypelagic prokaryotes are generally underestimated due to sample decompression. To study prokaryotes under in situ conditions, we have a hyperbaric technology that can be used as a ready-to-use pressurized sampler capable of collecting and maintaining samples under in situ conditions, but also to simulate the increase of hydrostatic pressure. The results highlight that by maintaining the pressure conditions, it is possible to sample piezophilic microorganisms. These results confirm our experimentation on the degradation of high molecular weight dissolved organic matter by a community adapted to the deep environment. Finally, we have also shown the importance of environmental conditions to study the fate of organic matter in the water column
 
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