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Herrmann, Jean-Louis (1959-....).

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Works: 28 works in 31 publications in 2 languages and 57 library holdings
Roles: Editor, Thesis advisor, Other, Opponent, Author, Contributor
Publication Timeline
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Most widely held works by Jean-Louis Herrmann
Rémic : référentiel en microbiologie médicale by Société française de microbiologie( Book )

1 edition published in 2015 in French and held by 14 WorldCat member libraries worldwide

European manual of clinical microbiology( Book )

2 editions published in 2012 in English and held by 10 WorldCat member libraries worldwide

Genetic determination of the effect of post-translational modification on the innate immune response to the 19 kDa lipoprotein of Mycobacterium tuberculosis by Katalin A Wilkinson( )

1 edition published in 2009 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Genome-wide mosaicism within Mycobacterium abscessus: evolutionary and epidemiological implications by Guillaume Sapriel( )

1 edition published in 2016 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

ASPECTS GENETIQUES ET EPIDEMIOLOGIQUES DES LEPTOSPIRES PATHOGENES by Jean-Louis Herrmann( Book )

2 editions published in 1993 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

LA LEPTOSPIROSE EST UNE INFECTION GENERALISEE AIGUE, CARACTERISEE PAR UNE VASCULARITE ETENDUE, ET DUE A DES SPIROCHETES APPARTENANT AU GENRE LEPTOSPIRA. C'EST PRINCIPALEMENT UNE PATHOLOGIE ATTEIGNANT LES ANIMAUX DOMESTIQUES ET SAUVAGES; L'HOMME N'ETANT QUE RAREMENT INFECTE PAR CONTACT DIRECT OU INDIRECT AVEC CES ANIMAUX. AU SEIN DE LA FAMILLE DES LEPTOSPIRACEAE, ON DISTINGUE L. INTERROGANS (SENSU LATO) PATHOGENE ET L. BIFLEXA (SENSU LATO) SAPROPHYTE. SUR LA BASE DES RESULTATS D'HYBRIDATION ADN-ADN, LES LEPTOSPIRES PATHOGENES ONT ETE SUBDIVISES EN 7 ESPECES GENOMIQUES, REGROUPANT CHACUNE DES SEROVARS D'ORIGINE ET D'ANTIGENICITE DIFFERENTS. LE SEROVAR REPRESENTAIT AUPARAVANT LE TAXON DE BASE DE L'ESPECE ET ACTUELLEMENT PLUS DE 200 SEROVARS ONT ETE IDENTIFIES CHEZ LES LEPTOSPIRES PATHOGENES. GRACE A LA REALISATION DES ETUDES DU GENOME DE CES BACTERIES PAR ELECTROPHORESE EN CHAMP PULSE, PLUSIEURS AVANCEES ONT ETE FAITES QUANT A LA COMPREHENSION DE CES BACTERIES. A L'AIDE DE L'ENZYME DE RESTRICTION NOTI, A FAIBLE NOMBRE DE SITES DE COUPURE, NOUS AVONS PU METTRE EN EVIDENCE UNE GRANDE HETEROGENEITE DES DIFFERENTS SEROVARS PRESENTS DANS CHAQUE ESPECE GENOMIQUE, PERMETTANT DE DEFINIR POUR CHACUN UNE CARTE D'IDENTITE. DE PLUS, UN MEME SEROVAR PATHOGENE, ISOLE DANS DIFFERENTES REGIONS DU MONDE ET A DES PERIODES DIFFERENTES, A PRESENTE UN PROFIL DE RESTRICTION NOTI SIMILAIRE A CELUI DE L'ANCIEN SEROVAR DE REFERENCE ISOLE EN 1917 DANS L'EST DE LA FRANCE. L'ENSEMBLE DE CES CARACTERES S'EXPLIQUE D'UNE PART PAR LE LONG TEMPS DE GENERATION DE CES BACTERIES AINSI QUE L'ABSENCE D'ACQUISITION D'ADN HETEROLOGUE, CONFIRMANT LA STABILITE GENETIQUE ET D'AUTRE PART, L'EXISTENCE DE SEQUENCES D'INSERTION ET PAR LA MEME D'EVENEMENTS DE RECOMBINAISON AYANT AMENE CETTE HETEROGENEITE ENTRE SEROVARS. J'AI CONTRIBUE EGALEMENT A LA CONSTRUCTION DE LA CARTE PHYSIQUE ET GENETIQUE DU SEROVAR PATHOGENE: ICTEROHAEMORRHAGIAE SOUCHE VERDUN. LES GENES CODANT POUR LES ARN 16, 23 ET 5S ONT ETE RETROUVES DISPERSES SUR LE CHROMOSOME. LA COMPARAISON DE 2 CARTES GENETIQUES DES SEROVARS ICTEROHAEMORRHAGIAE, ET POMONA, DONT LA CARTE PHYSIQUE A ETE REALISEE PAR R. ZUERNER, A CONFIRME L'HETEROGENEITE MISE EN EVIDENCE PAR L'ELECTROPHORESE EN CHAMP PULSE. LES GENES GYRBA, GIDA ET DNAA, ONT ETE LOCALISES POUR LES 2 SEROVARS, CE QUI PERMET DE PRECISER L'ORIGINE DE REPLICATION POUR CHACUNE DES SOUCHES PAR ANALOGIE A CE QUI EST OBSERVE CHEZ LA PLUPART DES BACTERIES. LA LOCALISATION DU GENE ASD SUR LE GRAND PLASMIDE DE 350 KB, PERMET DE CONSIDERER CE REPLICON COMME UN MINICHROMOSOME
Etude de la virulence de "Yersinia pseudotuberculosis" par mutagène par transposition by Jean-Louis Herrmann( Book )

1 edition published in 1989 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Predicting susceptibility to tuberculosis based on gene expression profiling in dendritic cells by John D Blischak( )

1 edition published in 2017 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Etude des mécanismes moléculaires impliqués dans le changement de phase lisse (S) à rugueuse (R) chez Mycobactérium abscessus by Guillaume Garnier( Book )

in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Mycobacterium abscessus est une mycobactérie à croissance rapide atypique. Elle possède de surcroit un fort pouvoir pathogène. Le nombre d'infections provoquées par M. abscessus est en pleine expansion, à tel point qu'elle est désormais reconnue comme étant un pathogène émergent, en particulier chez les patients atteints de mucoviscidose. Comme d'autres mycobactéries, M. abscessus possède la particularité de se retrouver sous deux morphotypes, un lisse (S) et un rugueux (R), le morphotype R présentant un caractère hypervirulent aussi bien chez le modèle murin que chez l'homme, ainsi qu'une persistance accrue au sein de l'hôte pouvant s'étendre jusqu'à une décennie. Durant cette thèse nous avons entrepris d'étudier les mécanismes moléculaires impliqués dans le changement de phase lisse à rugueuse chez M. abscessus, afin de mieux discerner la différence de pathologie constatée entre les deux morphotypes de M. abscessus
Analyse en microscopie confocale du phagosome bactérien au sein de cellules dendritiques humaines : étude de salmonella typhi et listeria monocytogènes comparées à mycobacterium tuberculosis by Anne Jamet( Book )

1 edition published in 2007 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les cellules dendritiques (DC) phagocytent les agents pathogènes au niveau des tissus périphériques puis migrent vers les organes lymphoïdes secondaires afin d'activer les lymphocytes T naïfs. Certaines bactéries peuvent résister à l'action bactéricide des cellules phagocytaires, comme les macrophages (MP) ou les DC, en modifiant à leur avantage la maturation en phagolysosome de la vacuole de phagocytose ou phagosome. Ce phagosome va alors pouvoir interagir avec les voies de biosynthèse et de recyclage cellulaires, offrant ainsi les nutriments nécessaires à une multiplication bactérienne. Mais, contrairement à ce qui est observé dans le MP, Mycobacterium tuberculosis ne se multiplie pas dans les DC et persiste dans un phagosome déconnecté des voies de biosynthèse ou de recyclage cellulaire. Cette différence pose la question d'un contrôle de la multiplication bactérienne par les DC ou d'un contrôle lié à des facteurs propre à la bactérie. Utilisant le même modèle d'interaction avec les DC, nous avons étudié le phagosome contenant deux bactéries intracellulaires pathogènes pour l'homme : Listeria monocytogenes et Salmonella Typhi par microscopie confocale. Nos résultats montrent que ces deux bactéries survivent aussi sans se multiplier dans les DC. Les phagosomes contenant ces bactéries présentent des marqueurs d'endosome tardif mais ne s'acidifient pas. Ils n'interagissent ni avec le reticulum endoplasmique ni avec l'appareil de Golgi. Les différences existant entre les phagosomes bactériens de M. tuberculosis, L. monocytogenes et S. Typhi confirment le rôle prédominant des facteurs bactériens spécifiques de chaque espèce dans l'établissement d'une niche de survie intracellulaire. Les DC jouent un rôle en limitant la croissance intracellulaire des bactéries. Mais la persistance de bactéries viables dans les DC peut favoriser leur dissémination
Epidémiologie de la leptospirose aux Antilles françaises : apports du diagnostic par biologie moléculaire dans l'étude des facteurs de risques, des facteurs pronostiques et de l'incidence by Patrick Hochedez( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Leptospirosis is the most widespread zoonosis in the world and its incidence is higher in in tropical areas where its fatality rates can exceed 10%. Availability of rapid diagnostic tools is a top-priority, since antibiotic is more efficient when given early. In this work, we rely on molecular diagnosis (RT-PCR) to contribute to the study of leptospirosis epidemiology in the Caribbean. In the first two papers, we describe for the first time in Martinique outbreaks of leptospirosis after sporting events (trail running, canyoning). The occurrence of cutaneous abrasions was identified as a risk factor for infection and data from those outbreaks suggest that rapid diagnostic assays such as PCR are particularly appropriate in this setting for early diagnosis, information of exposed participants, and treatment during acute phase of the disease. The third paper is a cohort study of 102 patients and we report that high level leptospiremia at the time of admission was associated with severity of the disease. The main clinical findings at the time of admission that were associated with severe leptospirosis included: hypotension, chest auscultation abnormalities, icterus, and oligoanuria. Identification of Leptospira interrogans species, serovar Icterohaemorrhagiae/Copenhageni, and the presence of rats in the house were also associated with severity. Detection methods using RT-PCR allowed us to contribute to the study of risk and prognostic factors, but also to have a better understanding of leptospirosis public health impact in the Caribbean
Macrophages et Mycobacterium abscessus : réponse pro-inflammatoire et survie intracellulaire des variants lisses et rugueux de Mycobacterium abscessus by Anne-Laure Roux( Book )

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Mycobacterium abscessus est la principale mycobactérie à croissance rapide (MCR) responsable d'infections pulmonaires chez l'homme. M. abscessus est caractérisée comme d'autres mycobactéries non tuberculeuses (MNT) par une hétérogénéité phénotypique avec l'existence d'un variant lisse (S) et d'un variant rugueux (R). Le variant R est associé à une réponse hyper-inflammatoire mais aussi à une plus grande virulence dans un modèle d'étude murin. Grâce à des approches biochimique, protéomique et transcriptomique, nous avons mis en évidence une augmentation de l'expression de lipoprotéines agonistes TLR2 à la surface de M. abscessus R responsables de son caractère «hyper-inflammatoire». Bien qu'appartenant au groupe des MCRs, certains éléments évoquent un comportement proche de celui des mycobactéries à croissance lente (MCLs) pathogènes. Différentes observations nous font penser que M. abscessus serait un pathogène intracellulaire vrai. L'étude du comportement intracellulaire de M. abscessus S/R nous a permis d'observer une croissance intracellulaire des variants S et R dans les macrophages murins, à l'inverse, aucune multiplication intracellulaire n'a pu être démontrée dans les cellules dendritiques murines. Après étude de l'acidification du phagosome, nous confirmons que sur le même modèle que les MCLs, M. abscessus variant S entraîne un défaut d'acidification du phagosome à la fois après infection de macrophages mais aussi de cellules dendritiques. Seul le phagosome du variant R de M. abscessus est acide au sein des macrophages. Enfin, un des résultats les plus surprenants est la mise en évidence de la sortie du phagosome dans le cytoplasme du variant S de M. abscessus
Défenses innées antivirales du poisson zèbre : de la signalisation aux cellules specialisées by Elina Aleksejeva( )

1 edition published in 2016 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Cette thèse est basée sur deux projets principaux: (1) l'étude de la réponse innée antivirale du poisson zèbre, en particulier des voies de signalisation des interférons de type I et (2) l'étude de leucocytes particuliers localisés au voisinage des neuromastes, structures permettant au poisson de percevoir le flux d'eau qu'il traverse et constituant potentiellement des brèches dans la peau de l'animal. La voie des IFN de type I est le principal composant de l'immunité antivirale innée. Dans cette thèse, deux types de protéines de poisson-zèbre capables d'augmenter l'induction des IFN de type I ont été étudiés. Nous avons montré que les deux orthologues chez le poisson zèbre du facteur de transcription à domaine BTB/POZ nommé PLZF (Promyelocytic leukemia zinc finger) augmentent l'induction de l'Ifn par différents stimuli. Ce travail montre que l'implication de PLZF dans la régulation de la voie IFN est ancienne et peut intervenir à différents niveaux de la voie Ifn. Le second modèle étudié est le gène Ftr83 (finTRIM83), qui appartient à un groupe de TRIM très diversifié et spécifique des poissons. L'expression de cette protéine TRIM induit une très forte induction des Ifn de type I et une protection contre différents virus, via la surexpression de différents ISGs. Ftr83 est exprimé dans la peau et dans les branchies, régions très exposées aux pathogènes, et son niveau d'expression est fortement corrélé au niveau d'expression de l'Ifn. Dans cette thèse, une lignée transgénique où les cellules spécifiquement fluorescentes évoquent des leucocytes localisés à proximité des neuromastes a été étudiée. Ces cellules ont été observées, leurs mouvements suivis et leur transcriptome analysé par séquençage profond après tri au FACS. Cette analyse a identifié des marqueurs typiques de cellules myéloides (macrophages, dendritiques); ces observations sont cohérentes avec l'idée de cellules sentinelles autour des neuromastes
Phenol Soluble Modulins et lipopolysaccharide de Legionella pneumophila : rôle dans la réponse immunitaire innée by Anne-Gaëlle Ranc( )

1 edition published in 2018 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Legionella pneumophila (Lp) est une bactérie ubiquitaire dans les environnements aqueux et responsable d'une pneumopathie potentiellement sévère : la légionellose. La majorité des souches impliquées appartiennent au sérogroupe 1 (Lp1) et à un sous- groupe spécifique de souches portant un épitope particulier dites mAb3/1+. Cependant, la différence de distribution entre les souches retrouvées dans l'environnement et celles impliquées en clinique n'est pas clairement élucidée. Notre travail a porté sur la détection de deux facteurs de virulence de Lp. Nous avons voulu mettre en évidence l'existence de Phenols Soluble Modulines (PSMs), peptides uniquement décrit chez Staphylocoques et avons ainsi pu démontrer l'activité de peptides prédits par analyse in silico chez Lp capables d'activer la réponse inflammatoire par la voie du NF-?B et sont dotés d'une action cytotoxique. Notre deuxième axe d'étude a porté sur le lipopolysaccharide (LPS) de Lp. Afin de vérifier si la prédominance de certaines souches était liée à un biais diagnostique, nous avons voulu tout d'abord vérifier la sensibilité de 3 tests urinaires diagnostiques envers le LPS extrait de souches de différents sous- groupes de Lp1 et sérogroupes de Lp et avons ainsi pu montrer que ces tests sont capables de détecter tous les LPS de Lp1. La sensibilité envers le LPS des autres sérogroupes est très variable mais reste insuffisante pour permettre leur détection. Nous avons ensuite utilisé ces LPS extraits pour vérifier la réponse immunitaire innée en fonction des souches de Lp1. Ainsi les souches mAb3/1+ activent moins le système immunitaire que les souches mAb3/1-, ce qui pourrait expliquer alors une moins bonne clairance de ces souches permettant leur multiplication à l'origine d'une infection. Au final, notre travail a permis d'étudier deux facteurs de virulence potentiels au sein de Lp, pouvant expliquer partiellement la prédominance de certaines souches en pathologie humaine
Étude fonctionnelle et intérêt thérapeutique des MmpL chez Mycobacterium abscessus by Christian Dupont( )

1 edition published in 2016 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Mycobacterium abscessus est une mycobactérie pathogène émergente à croissance rapidecapable d'induire des infections pulmonaires sévères, notamment chez les patients atteints demucoviscidose. Naturellement résistant à la plupart des antibiotiques disponibles, sa présence peut êtreune contre-indication à la greffe pulmonaire chez ces patients. De plus, l'efficacité des traitementsactuellement préconisés est très fluctuante d'un individu à l'autre et s'accompagne souvent d'effetssecondaires indésirables. Il apparaît donc urgent de développer des stratégies thérapeutiques innovanteset/ou d'identifier de nouvelles cibles pharmacologiques dans la lutte contre ce pathogène. Ce projet dethèse, focalisé sur M. abscessus, est centré sur l'étude mécanistique et fonctionnelle des transporteursmembranaires de la famille des MmpL (Mycobacterial Membrane Protein Large) en rapport avec leur rôledans i) l'élaboration de l'enveloppe mycobactérienne, ii) la physiopathologie infectieuse et iii) leurvalidation en tant que cible d'intérêt thérapeutique.Ainsi, mes travaux ont permis de mettre à jour le rôle clé de MmpL4a dans le transport desglycopeptidolipides (GPL) chez Mycobacterium bolletii, une sous-espèce du complexe M. abscessus et dedémontrer sa participation dans la formation de biofilms, des cordes mycobactériennes et dans la virulencede M. bolletii chez l'embryon de zebrafish. De plus, ces résultats mettent en exergue l'importance derésidus critiques impliqués dans l'établissement de la force proto-motrice, conservés chez toutes les MmpL,et nécessaires à l'activité de ces transporteurs. Enfin, ces études ont abouti à l'identification d'une nouvelleentité chimique très active contre M. abscessus à la fois in vitro et in vivo. Ce composé phare est capable decibler le MmpL3, conduisant à une inhibition du transport des acides mycoliques, connus comme étant descomposants essentiels chez les mycobactéries. Ces travaux représentent le premier exemple d'un inhibiteurciblant spécifiquement le transport d'acides mycoliques chez M. abscessus, ouvrant la voie vers desapplications thérapeutiques prometteuses
Les L,D-transpeptidases, cibles des carbapénèmes chez Mycobacterium tuberculosis by Mathilde Cordillot( )

1 edition published in 2013 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Impact des antibiotiques sur la réponse des macrophages humains : l'exemple de la bédaquiline by Alexandre Giraud-Gatineau( )

1 edition published in 2019 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les antibiotiques sont largement utilisés dans le traitement des infections bactériennes. Connus pour leur activité sur les bactéries, les antibiotiques peuvent également interférer avec le système immunitaire de l'hôte. L'objectif de cette thèse a été d'étudier l'impact de la bédaquiline (BDQ), un récent anti-tuberculeux, sur la réponse des macrophages humains. L'analyse de l'expression des gènes a pu révéler que la BDQ reprogramme les macrophages en augmentant l'expression des gènes liée aux fonctions bactéricides. Nous avons découvert que l'expression de 1495 gènes étaient différentiellement exprimées dans les macrophages infectés par Mycobacterium tuberculosis et traités par la BDQ, avec une régulation positive des gènes impliqués dans le métabolisme et l'activation des lysosomes et leur biogénèse. Le traitement par la BDQ a permis d'activer divers mécanismes de défense antimicrobiens, notamment la production d'oxyde nitrique, la fusion phagosome-lysosome et l'autophagie. Ces effets sont associés à l'activation du facteur de transcription EB, impliqué dans l'expression des gènes lysosomaux, entrainant une diminution de la survie intracellulaire de différentes espèces bactériennes naturellement resistante à la BDQ. Ainsi, la BDQ pourrait être utilisé comme composé HDT (host-directed therapy) contre les infections bactériennes
Identification et caractérisation des gènes impliqués dans la virulence des Leptospires by Célia Fontana( )

1 edition published in 2016 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Leptospirosis is a worldwide zoonosis responsible for more than 1 million human cases and severe infections in animals. The causative agents are pathogenic species of Leptospira. The virulence mechanisms of these atypical bacteria remain largely unknown. Human and animal vaccines exist but the protection is restricted to a few serovars, representing only partially the complex and fluctuating epidemiology of the disease. The aims of the thesis presented in this manuscript were to characterize new virulence factors on Leptospira on the one hand and to identify new cross-protective vaccine candidates on the other hand, in the context of the COVALEPT collaborative project led by Merial, gathering industrial and academic partners. First, a flow cytometry based enumeration method for leptospires was developed, more rapid and efficient than the current standard technique. Then, the study of mutants generated by random transposition and spontaneously avirulent strains led to the identification of three virulence factors: LIC12144, required for lipopolysaccharides biosynthesis, FliM, essential for motility, and LIC11221 which may be involved in chemotaxis. Finally, two vaccine candidates conferring partial protection against the disease in a rodent model were conceived, a recombinant protein and a live attenuated strain. Altogether, this work brings new knowledge on Leptospira virulence and supports the development of broad spectrum vaccines against leptospirosis
Contributions à l'étude de l'échappement des leptospires au système immunitaire : mise en évidence chez la souris de la colonisation rénale chronique à l'aide de leptospires bioluminescents, et rôle de la lipoprotéine LipL21 dans l'échappement du peptidoglycane à la reconnaissance par les récepteurs Nods by Gwenn Ratet( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

La leptospirose, due aux bactéries Leptospira interrogans ou leptospires, est une zoonose ré-émergente de répartition mondiale et susceptible de se répandre en France en raison du réchauffement climatique. Les rongeurs, en particulier les rats, sont le réservoir asymptomatique des leptospires. Chez l'Homme, l'infection conduit soit à un syndrome pseudo-grippal bénin, soit à la maladie de Weil, qui se traduit par des déficiences hépatiques, rénales et pulmonaires sévères pouvant entraîner la mort. Le laboratoire a montré que les leptospires échappent à la détection par certains récepteurs de l'immunité innée de la famille des Toll-like (TLR). En effet, le lipopolysaccharide (LPS) des leptospires - composant majeur de la membrane externe - est atypique et n'est pas reconnu par le TLR4 humain, contrairement au LPS de la plupart des bactéries à Gram négatif. Cependant chez la souris, le LPS des leptospires est reconnu par le TLR4 et permet une élimination de la bactérie. Au cours de cette thèse, nous avons mis en évidence un nouveau mécanisme d'échappement des leptospires à la reconnaissance par les récepteurs de l'immunité innée Nod1 et Nod2, reconnaissant les fragments de dégradation du peptidoglycane bactérien, appelés muropeptides. Nous avons montré que la liaison au PG d'une lipoprotéine, la LipL21, spécifique de la membrane externe des leptospires, bloque la digestion en muropeptides et permet ainsi l'échappement des leptospires à la reconnaissance par les récepteurs Nods. Ceci constitue une nouvelle stratégie bactérienne d'échappement au système immunitaire inné. En effet, jusqu'alors seules des modifications des sucres ou de la chaîne peptidique du peptidoglycane entraînant le blocage de la reconnaissance par les récepteurs Nods avaient été mis en évidence. Par ailleurs, nous avons développé - grâce à la construction d'une souche de leptospires pathogènes bioluminescents - un nouveau modèle d'étude de la leptospirose aiguë et chronique chez la souris, qui à l'instar des rats et contrairement à ce que l'on pensait, est un porteur asymptomatique et chronique des leptospires dans les reins. Ce modèle biphasique de la leptospirose nous a permis de mettre en évidence que les leptospires sont protégés de l'action des antibiotiques lorsqu'ils sont dans les reins, alors qu'ils y sont sensibles lors de la phase aiguë. Ces résultats suggèrent deux mécanismes différents participant à l'échappement des leptospires au système immunitaire de l'hôte : d'une part, la lipoprotéine LipL21 joue un rôle dans le blocage de la reconnaissance du peptidoglycane par les récepteurs Nods et d'autre part, les leptospires échappent aux défenses de l'hôte par la colonisation rénale chez la souris
Microbiologie clinique et spectrométrie de masse by Stéphanie Suarez( )

1 edition published in 2013 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Until now, bacterial and fungal identification has been based on biochemical characterization of microorganisms. The Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Spectrometry (MALDI-TOF MS) has recently been developed in clinical microbiology laboratories. This new technology allows a rapid, accurate and less expensive identification of bacterial and fungal colonies grown on agar media. First, we have shown that the direct identification of bacteria grown in liquid media such as blood cultures was possible, without waiting for a subculture on solid media. Since the diagnosis is available on the first day, the presumptive antimicrobial treatment can be rapidly adapted according to the usual resistance phenotype of the microorganism. We have then searched to identify the biomarkers used for the identification of bacteria, using Neisseria meningitidis as a model. Comparing the genome and the proteome of sequenced strains allowed us to identify the ribosomal proteins as thoses involved in the MALDI-TOF MS diagnosis. Ribosomal proteins are very abundant and are very often used as epidemiological tools : their variations on the bacteria mass spectrum allows an intra-species differentiation of several strains. Finally we present encouraging preliminary results based on the detection of consistent ribosomal proteins directly visible on the mass spectrum that lead to the accurate identification of some very close species such as Streptococcus pneumoniae and Streptococcus mitis
 
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Jean-Louis Herrmann researcher

Jean-Louis Herrmann wetenschapper

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