WorldCat Identities

Ruimy, Raymond

Overview
Works: 41 works in 46 publications in 2 languages and 65 library holdings
Roles: Other, Thesis advisor, Opponent, Author, Contributor
Classifications: R1, 616.9
Publication Timeline
.
Most widely held works by Raymond Ruimy
ETUDE DE LA TAXONOMIE ET DE L'ECOLOGIE BACTERIENNES PAR L'ANALYSE DES SEQUENCES D'ARN RIBOSOMIQUES 16S by RAYMOND RUIMY( Book )

2 editions published in 1996 in French and held by 4 WorldCat member libraries worldwide

L'ANALYSE COMPARATIVE DES SEQUENCES D'ARN RIBOSOMIQUES 16S A REVOLUTIONNE LA TAXONOMIE BACTERIENNE EN PERMETTANT D'ETABLIR UNE PHYLOGENIE DES ESPECES BACTERIENNES. EN CONSEQUENCE, DE NOMBREUX GENRES ET FAMILLES ONT ETE REMANIES. NOUS AVONS POURSUIVI CETTE MISE A JOUR EN DETERMINANT ET ANALYSANT PAR LES METHODES DE PHYLOGENIE MOLECULAIRE LES SEQUENCES D'ARNR 16S DE BACTERIES APPARTENANT AUX GENRES DU PHYLUM DES PROTEOBACTERIES (AEROMONAS, PHOTOBACTERIUM, PLESIOMONAS, VIBRIO) ET DU GROUPE CMN (NOCARDIA, CORYNEBACTERIUM, GORDONA, RHODOCOCCUS). NOUS AVONS ENSUITE DECRIT DE NOUVELLES ESPECES APPARTENANT A CES GENRES ET SUGGERE, SUR LA BASE DE NOS RESULTATS, QU'UNE BACTERIE DONT LA SEQUENCE D'ARNR 16S EST DIFFERENTE DE PLUS DE 1.5 % DE TOUTE AUTRE SEQUENCE EST GENERALEMENT UNE NOUVELLE ESPECE. AU DESSOUS DE CETTE LIMITE, LES RESULTATS DES ANALYSES PHYLOGENETIQUES INDIQUENT AVEC QUELLES BACTERIES LES HYBRIDATIONS ADN/ADN DEVONT ETRE REALISEES. EN COMPARANT LES SEQUENCES D'ARNR 16S, IL EST EGALEMENT POSSIBLE DE DEDUIRE DES SEQUENCES SIGNATURES A DIFFERENTS NIVEAUX TAXONOMIQUES. NOUS AVONS PAR EXEMPLE DETERMINE UNE PAIRE D'OLIGONUCLEOTIDES QUI ONT PERMIS PAR PCR DE CIBLER SPECIFIQUEMENT UNE SOUCHE BACTERIENNE RESPONSABLE D'IFECTIONS NEONATALES ALORS QU'ELLE EST PHENOTYPIQUEMENT CONFONDUE AVEC HAEMOPHILUS INFLUENZAE BIOTYPE IV. NOUS AVONS UTILISE UNE SONDE FLUORESCENTE POUR QUANTIFIER LE CONTENU CELLULAIRE EN ARNR AU COURS DES DIFFERENTES PHASES DE LA CROISSANCE BACTERIENNE PAR UN SYSTEME D'ANALYSE D'IMAGE COUPLE AU MICROSCOPE A EPIFLUORESCENCE ET MONTRE QU'IL REFLETE VRAISEMBLABLEMENT L'ETAT D'ACTIVITE BACTERIENNE. ENFIN, NOUS AVONS EVALUE LES APPLICATIONS DE L'ANALYSE DES SEQUENCS D'ARNR 16S POUR ETUDIER LA DIVERSITE DES POPULATIONS BACTERIENNES DE DEUX ENVIRONNEMENTS DIFFERENTS : ARGILE DE GRANDE PROFONDEUR PAUVRES EN BACTERIES CULTIVABLES ET LA MATIERE PARTICULAIRE EN MER MEDITERRANEE RICHES EN BACTERIES. EN CONCLUSION, L'ANALYSE DES SEQUENCES D'ARNR 16S PERMET DE CARACTERISER ET DE DETECTER UNE SOUCHE BACTERIENNE BEAUCOUP PLUS PRECISEMENT QUE LES METHODES PHENOTYPIQUES. C'EST LA MEILLEURE APPROCHE POUR ESTIMER LA DIVESITE DES POPULATIONS BACTERIENNES D'ECHANTILLONS PROVENANT DE L'ENVIRONNEMENT
EVALUATION DE L'EFFICACITE ET DE LA TOXICITE DE LA ZIDOVUDINE IN VITRO by Raymond Ruimy( Book )

1 edition published in 1991 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Tobacco-smoking-related prevalence of methanogens in the oral fluid microbiota by Ghiles Grine( )

1 edition published in 2018 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les Archaea méthanogènes comme pathogènes opportunistes by Vanessa Demonfort Nkamga( )

1 edition published in 2016 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les méthanogènes sont des Archaea anaérobies stricts, connus pour être les seuls êtres vivants capables de produire du méthane comme sous-produit de leur métabolisme. Notre revue de littérature a montré qu'outre les espèces environnementales, l'ordre des Methanomassiliicoccales ne comptait à ce jour qu'une seule espèce Methanomassiliicoccus luminyensis isolée et cultivée dans notre laboratoire. Aucours de notre thèse, nous avons développé une nouvelle méthode permettant la culture et l'isolement des méthanogènes en absence de source externe de dihydrogène (H2) d'une part et d'autre part une méthode de génotypage Multispacer Sequence Typing (MST) basée sur le séquençage d'espaces intergéniques pour typer Methanobrevibacter smithii et M. oralis. Par la suite, nous avons mis en évidence la présence de méthanogènes en situation pathologique chez l'homme. Nous avons détecté et isolé pour la première fois au sein de flores anaérobies, M. oralis à partir d'échantillons d'abcès cérébraux, et de sinusite d'une part, et d'autre part M. smithii à partir d'un échantillon de patient souffrant d'abcès para-vertébral. Enfin, dans la cinquième partie de notre thèse, nous avons testé in vitro la sensibilité de cinq méthanogènes associés aux flores humaines à la lovastatine qui est une pro-drogue utilisée pour abaisser la concentration de cholestérol chez l'homme dans le cadre de certaines pathologies. Les cinq méthanogènes se sont avérées sensibles à une concentration minimale inhibitrice de 1µg/mL, après activation par hydrolyse de la lovastatine par des bactéries anaérobies du microbiote digestif, via une l'inhibition de la croissance et de la production du méthane
Seawater drowning-associated pneumonia: a 10-year descriptive cohort in intensive care unit by Alexandre Robert( )

1 edition published in 2017 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Sediminibacillus massiliensis sp. nov., a moderately halophilic, Gram-positive bacterium isolated from a stool sample of a young Senegalese man by Bruno Senghor( )

1 edition published in 2018 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

RNY-derived small RNAs as a signature of coronary artery disease by Emanuela Repetto( )

1 edition published in 2015 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Infectious endocarditis caused by Helcococcus kunzii in a vascular patient: a case report and literature review by Romain Lotte( )

1 edition published in 2015 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Achromobacter spp. et spectrométrie de masse MALDI-TOF, construction d'une base de données et application à l'étude épidémiologique des infections. by Thomas Garrigos( )

2 editions published in 2021 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Achromobacter spp. (19 species) is an emerging pathogen in cystic fibrosis patients. Data on species or types are lacking to understand the epidemiology and clinical impact in these patients. Indeed, the reference methods for species identification and typing are molecular biology techniques not applicable in the diagnostic laboratory. We have built the first MALDI-TOF mass spectrometry database (Bruker) comprising 18 Achromobacter species including 205 strains identified by the reference method (nrdA gene sequencing). Two typing strategies (MALDI Biotyper; ClinProTools) were compared to MultiLocus Sequence Typing and Pulse Field Electrophoresis, including 202 clinical or environmental strains of A. xylosoxidans and A. ruhlandii (USA, Denmark, France and Belgium). This study is the first to compare the MALDI-TOF mass spectrometry technique with nrdA gene sequencing for species-level identification of bacteria of the genus Achromobacter. The use of our new database is a reliable alternative for the species identification of these bacteria and for typing, including the detection of the epidemic multiresistant clonal strains A. xylosoxidans ST 137 and A. ruhlandii DES. Moreover, as our database is reliable, it allowed us to conduct a retrospective epidemiological study in 12 French centers to describe the distribution of species and to detect the A. xylosoxidans ST 137 clone in cystic fibrosis patients in France in 2020. In total, 11 species were identified, with A. xylosoxidans being the most common species in each centre and the epidemic clone A. xylosoxidans ST 137 was detected in 4 patients from two centers. The use of this rapid method will thus allow a better understanding of the epidemiology of Achromobacter in these patients and guide future clinical studies
Epidémiologie de la tuberculose à l'hôpital Bichat-Claude Bernard de 1998 à 2004 et caractérisation moléculaire des souches du complexe Mycobacterium tuberculosis par spoligotypage by Mohand Djemai( Book )

1 edition published in 2006 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Tuberculosis remains a world health problem which occurs especially in the countries of Africa, India and more recently in Eastern Europe. In our country, the highest incidence is found in Paris area. In order to better know the epidemiology of the cases in Paris, we analyzed retrospectively the demographic and clinical data of patients represented by the cases of tuberculosis during the period of 1998 to 2004 at the hospital Bichat-Claude Bernard. We also analyzed the diversity of the strains obtained by spoligotyping according to the country of birth of the patients, HIV status and the tuberculosis presentation. The purpose of this molecular typing was also to document a possible nosocomial transmission among health care worker and the transmitted cases in the community. The 982 cases of tuberculosis diagnosed over the studied period are composed of 71% male , 76% of migrants and 24% HIV positive. The average age is 42 years. The pulmonary tuberculosis accounts for 67% of cases. The rate of multidrug resistance is of 2%.Les patient HIV positive are foreigners in 82% of the cases and significantly present more mixed tuberculosis and more multidrug résistance that HIV negative subjects. The spoligotyping of the strains of the Mycobacterium tuberculosis Complex generated 339 distinct profiles of which 240 (70%) are orphan profiles. The other profiles are distributed in 99 clusters with on average of 7 strains per cluster [ 2-114 ]. The Asian patients and extra pulmonary tuberculosis present more orphan profiles than the clustered profiles whereas the pulmonary tuberculosis present more profiles in clusters. A nosocomial transmission of tuberculosis was found
Decreased susceptibility to chlorhexidine affects a quarter of Escherichia coli isolates responsible for pneumonia in ICU patients by Béatrice La Combe( )

1 edition published in 2018 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

First autochthonous familial cluster of invasive community-acquired leukocidin-positive methicillin-resistant USA300 Staphylococcus aureus in France by Philippe Traore( )

1 edition published in 2014 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Impact des fluoroquinolones sur la résistance bactérienne dans les microbiotes humains = mpact of fluoroquinolones on bacterial resistance in human microbiota by Victoire de Lastours( Book )

2 editions published in 2014 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les fluoroquinolones (FQ) sont des antibiotiques parmi les plus prescrits au monde. L'augmentation importante des prescriptions de FQ est accompagnée de l'émergence inquiétante de la résistance bactérienne responsable d'échecs cliniques et d'émergence de bactéries multi-résistantes. Les FQ diffusent très bien dans les écosystèmes, expliquant leur impact particulier au niveau des microbiotes. Or, les microbiotes humains constituent un réservoir majeur de la résistance bactérienne. Dans un premier volet épidémiologique, nous avons déterminé la prévalence du portage de résistance aux FQ dans les différents microbiotes de patients hospitalisés ainsi que les taux d'émergence de résistance chez des patients traités par FQ. Nous avons montré que chaque microbiote se comportait de façon indépendante en termes de facteurs de risque de portage de souches résistantes, comme d'émergence de la résistance sous traitement. Dans une seconde partie, nous avons montré dans le microbiote nasal et intestinal, que l'émergence de la résistance aux quinolones était un phénomène fréquent aux dynamiques variables, essentiellement dû à l'acquisition de souches résistantes exogènes. Enfin, nous avons montré que les souches résistantes pouvaient persister dans le tube digestif, parce qu'elles étaient particulièrement bien adaptées au commensalisme, leur conférant un avantage sélectif. Ceci expliquerait les taux importants de colonisation par des souches de Escherichia coli résistantes aux quinolones dans le microbiote intestinal chez l'homme avec la double conséquence d'augmenter les risques de transmission interindividuelle et les risques d'infections par ces souches résistantes
Rapid detection of glycopeptide-resistant enterococci: impact on decision-making and costs by Gabriel Birgand( )

1 edition published in 2013 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Évaluation d'un antibiogramme direct sur hémoculture en moins de 8h par méthode en diffusion sur Mueller-Hinton rapide by James Kasprzak( )

2 editions published in 2020 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Le délai de rendu de l'antibiogramme en gélose MH réalisé directement à partir d'un flacon d'hémoculture positif est habituellement de 16 à 24h. Le milieu MHR permet de réduire ce délai à 6-8h. Peu de données sont pour l'instant disponibles sur l'évaluation de ce milieu. Nous avons comparé les performances du milieu MHR versus MH pour la réalisation d'antibiogrammes à partir de flacons d'hémocultures positifs à entérobactéries et estimé le gain de temps sur le rendu de l'antibiogramme. La performance du milieu MHR a été étudiée avec une souche d'E. coli ATCC inoculée dans des flacons d'hémocultures. La sensibilité de 25 antibiotiques a été testée. Les résultats obtenus avec deux inoculum 1 goutte/5ml(1G) et 15 gouttes/9ml(15G) ont été comparés aux limites acceptables de la souche. Les antibiogrammes de 71 hémocultures positives à entérobactéries chez des patients en sepsis ont été comparés en milieu MHR versus MH. Le gain de temps a été calculé avec une validation des antibiogrammes de 8h30 à 17h. Sur les 1000 diamètres étudiés lors de l'étude de répétabilité, 20 diamètres étaient hors bornes avec un inoculum de 1G et 59 avec 15G(p<0,001). Sur les 1700 diamètres étudiés lors de l'étude de reproductibilité, nous avons eu 56 diamètres hors bornes avec un inoculum 1G et 91 avec un inoculum 15G(p=0,003). Sur les 1775 diamètres testés à partir des flacons d'hémocultures positifs à entérobactéries nous avons eu 7 erreurs avec le MHR : 1 minor, 5 Major et 1 Very Major Error soit une concordance de 99,6%. Le temps moyen théorique gagné sur le rendu de l'antibiogramme est de 16h. Nos résultats ont montré une excellente performance du milieu MHR et une bonne corrélation avec le MH
Adherence to antibiotic guidelines for erysipelas or cellulitis is associated with a favorable outcome by Camille Klotz( )

1 edition published in 2019 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

 
moreShow More Titles
fewerShow Fewer Titles
Audience Level
0
Audience Level
1
  General Special  
Audience level: 0.00 (from 0.00 for ETUDE DE L ... to 0.00 for ETUDE DE L ...)

Alternative Names
R Ruimy wetenschapper

Languages
English (13)

French (11)