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École doctorale Sciences et Environnements (Pessac, Gironde)

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Works: 360 works in 366 publications in 2 languages and 380 library holdings
Genres: Academic theses 
Roles: Other
Classifications: DC801.N68, 936.40126
Publication Timeline
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Most widely held works by Gironde) École doctorale Sciences et Environnements (Pessac
Influence de l'état sanitaire des populations anciennes sur la mortalité en temps de peste : contribution à la paléoépidémiologie by Sacha Kacki( )

1 edition published in 2016 in French and held by 14 WorldCat member libraries worldwide

Génératrice depuis le VIe siècle de notre ère de crises épidémiques récurrentes en Occident, la peste a profondémentmarqué l'histoire des sociétés européennes, tant sur le plan biologique que culturel, économique et politique. Sil'histoire des épidémies qu'elle a engendrées est aujourd'hui relativement bien connue, un certain nombre de questionssur ses caractéristiques épidémiologiques passées demeurent pour partie irrésolues. En particulier, le caractère sélectifou non de la mortalité par peste à l'égard de l'âge, du sexe et de l'état de santé préexistant des individus faitactuellement débat. À partir d'une approche anthropobiologique, le présent travail se propose de contribuer à cettediscussion. Il livre les résultats de l'étude d'un corpus de 1090 squelettes provenant, d'une part, de quatre sitesd'inhumation de pestiférés de la fin du Moyen Âge et du début de l'époque moderne et, d'autre part, de deuxcimetières paroissiaux médiévaux utilisés hors contexte épidémique. Cette étude révèle en premier lieu l'existenced'une signature démographique commune aux séries en lien avec la peste. Leur composition par âge et par sexe,distincte de celle caractérisant la mortalité naturelle, est au contraire en adéquation avec la structure théorique d'unepopulation vivante préindustrielle. L'examen de divers indicateurs de stress suggèrent par ailleurs que les victimes dela peste jouissaient, à la veille de leur décès, d'un meilleur état de santé que les individus morts en temps normal. Lesrésultats obtenus concourent à démontrer que les facteurs causals de ces lésions squelettiques, d'accoutuméresponsables d'une diminution des chances de survie, n'eurent au contraire qu'une influence mineure, si ce n'est nulle,sur le risque de mourir de l'infection à Yersinia pestis. Ce travail livre in fine un faisceau d'arguments convergents quitendent à prouver que les épidémies de peste anciennes furent à l'origine d'une mortalité non sélective, la maladiefrappant indistinctement les individus des deux sexes, de tous âges et de toutes conditions sanitaires
Bioarchéologie des sujets immatures de quatre nécropoles du haut Moyen Âge européen : méthodes d'étude du développement et des interactions biologie/culture by Virginie Garcin( )

1 edition published in 2009 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Thorough bioarchaeological studies of children populations are few, and their integration into the adult population is often limited. Nevertheless, it is well known that non-adult's teeth and skeletal remains give a wealth of information about their brief lives, and on the environment where they grew. This study is based on a large skeletal sample (N= 613 individuals ranging from perinates to late adolescence), dated from the Early Middle Age (essentially 9th-11th centuries AD) and belonging to very different lifestyle populations (urban vs. rural): Cherbourg Notre-Dame, Norroy-le-Veneur (France), Mikulcice Kostelisko and Prušánky 1 (Czech Republic) ; plus the identified collection from Spitalfields (London, UK) used for methodological issues. The topic of the study is threefold: Synthetic, comparative, and methodological, in order to give a global point of view on the children in a given bioarchaeological context. The biological patterns studied (age at death, intra- and inter-population variability, skeletal growth profiles) do not demonstrate significant differences between lifestyle, whereas non-specific stress indicators, caries lesions, and funerary practices do and can describe the environment where the children grew. It has also been possible to detect and demonstrate biological patterns within archaeological samples, which is a great result, totally unexpected considering all the biases of such studies. Finally, new methodological approaches have been built (secondary age estimation, dental mineralization sequences, skeletal growth profiles with the transition analysis), allowing a better integration of the immature individuals among large population syntheses. They highlight the non-adult part of population's great contribution to bioarchaeology
Dynamique des populations de palourdes japonaises (Ruditapes philippinarum) dans le bassin d'Arcachon : conséquences sur la gestion des populations exploitées by Cécile Dang( Book )

2 editions published in 2009 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

The Manila clam (Ruditapes philippinarum) was introduced into Arcachon Bay at the beginning of the 1980s for aquaculture purposes. It rapidly naturalized in all intertidal flats of the lagoon. Nowadays, Arcachon Bay ranks at the first French place in terms of exploitable stock. However, recent stock assessments have shown an unbalance size structure with a deficit in juvenile and adult clams (> 38 mm shell length). These alarming patterns asked many questions on the sustainability of Manila clam populations within Arcachon Bay and have motivated the present thesis. This study aimed to better understand the population dynamics of this species and also some factors controlling this dynamic. The final objective was to improve the Manila clam fishing management with a model raised with results of the study. Von Bertalanffy growth parameters (K and L8) were both determined by a field survey of populations and by a tagged-recapture experiment during two years. Growth appeared slow with a homogeneous K within the bay and different L8 according to the sites. This study also evidenced a normal natural mortality and an inefficient reproduction (low condition index, low recruitment). Among the factors that could explain these dynamics, different pathogens were monitored during two years: digenean trematodes, brown ring disease and perkinsosis. Moreover, an emergent pathology (brown muscle disease, BMD) has been discovered. Only perkinsosis and BMD revealed high prevalences and intensities. Perkinsosis induced mitigated effects on growth whereas BMD-infected clams rise to the surface of the sediment and died. Trophic sources were also important to explain growth and were studied with carbon and nitrogen stable isotopes. This study displayed a heterogeneous repartition of Manila clam trophic sources within the bay and a phytoplankton dominated diet. The proportion of ingested phytoplankton was correlated with L8. Growth and mortality parameters were integrated in a management model. If no new management measures were taken, the clam stock will continue to decrease. Different management situations have been simulated and new measures have been adopted by administrator organisms
Itinéraires et transformations du silex : une pétroarchéologie refondée, application au Paléolithique moyen by Paul Fernandes( Book )

2 editions published in 2012 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

The characteristics of their initial crystallization and the evidence for subsequent alterations present on the surfaces of prehistoric flint artifacts are the result of a range of interdependent physical, chemical and mechanical phenomenas. Once decoded, the information retrieved allows us to assign a genetical/stratigraphical position to the flint as well as a post-genetic paleo-geographical location. Both data sets reveal the story ofan objects successive residential contexts. This petro-archaeological analytical methodology, is based on anoptimization of the optical techniques commonly used in petrography, mineralogy, micro-palaeontology and morphoscopy using a range of magnifications is a simple tool for classifying objects and identifying the source of lithic raw materials. The limitations of the methodology are determined by the experience of the operatorand the geographical spread of available reference collections. A study of the various alterations to which lithic raw materials were subjected and which are recorded within their surface characteristics allows connections to be made between the lithic objects and the surface exposures where these characteristics manifest in the lithics rather than just seeing the objects from a perspective that does not connect them with landscapes and specific resource localities. Thus, the methodology used here allows the comparison of flint objects within the context of time and space, and within which the genesis of each object can be followed, thus resulting in a greater understanding of where, why and how, it was collected during prehistory. The geographical extent in which this research has been undertaken is wide and includes parts of Moroccoand the southern part of France and has taken place within broad investigations into lithic raw materials being conducted by a number of members of a research team. A trial of the methodology over such a broad spectrum of site locations has allowed an improvement to be made in the reliability of the analytical techniques that are required. This work aims to aid in the characterization of the lithic tools as they describe and catalogue the properties of palaeo-environmental changes that can be read on the surface of the flint. The outcome of this work is that it produces a greater understanding of the many physical, geological and environmental processes to which lithic objects have been subjected both before gathering by humans and after discard in the archaeological site. This helps for a more precise location of gathering areas and a better evaluation of the archaeological layers integrity. These results are expressed on large scale maps and stored in an indexing system which catalogues the varied characteristics of a large number of types of flint found in the South of France and the west central region of Morocco
Hommes et hyènes face aux recompositions des communautés d'Ongulés (MIS 5-3) : éléments pour un cadre paléoécologique des sociétés du Paléolithique moyen et supérieur ancien d'Europe de l'Ouest by Emmanuel Discamps( Book )

2 editions published in 2011 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

In Europe, climate is often considered as a key factor in explaining the events of the Middle-to-Upper Paleolithic transition (e.g. Neandertal extinction, development of innovations characteristic of “modern” behavior). However, the exact impact of Upper Pleistocene global climatic changes on terrestrial ecosystems is still poorly documented. This study proposes to place the evolutionary history of hominids from MIS 5 to 3 (before, during and after the Middle-to-Upper Paleolithic transition) within a paleoenvironmental and paleoecological context. Reconstruction of past terrestrial communities is here performed both on an ecosystem scale (changes in herbivore communities, fluctuations of ungulate biomass, paleodemography of cave hyenas) and on an intra-guild scale (interspecific competition between hominids and hyenas). This multi-scaled study is permitted through taphonomic, spatial and paleoecological analyses of two hyena dens with traces of human occupation (Camiac and La Chauverie), coupled with analyses of several databases of archeological and paleontological sites with a wide array of methods (archeostratigraphy, GIS, Bayesian and multivariate statistics). At the ecosystem scale, changes in herbivore communities are reconstructed for southwestern France. Fluctuations in ungulate biomass are noticeable, with an increase at the end of the Mousterian and a significant crash at the beginning of the Aurignacian. These changes had a pronounced impact on large predator populations, as can be shown by the high correlation between reconstructed hyena paleodemography and variations in ungulate biomass. At the intra-guild scale, interspecific competition between hominids and hyenas is shown to vary across time periods and regions. Niche overlap is at some times significant (as at the end of the Mousterian) in terms of resource exploitation (species of prey, population segments targeted, subsistence strategies), but total niche overlap is never observed. The nature of hominid-hyena interaction in caves is also discussed within the framework of an interdisciplinary analysis of the faunal and lithic collections of Camiac and La Chauverie. The model built in southwestern France is then compared with the specificity of other regions of Western Europe, by utilizing an extended database. These comparisons highlight the significant differences that exist between terrestrial communities regarding their responses to global climatic changes, depending on their geographical setting. These results bring new insights to the Middle-to-Upper Paleolithic transition: notably, it appears that environmental and ecological factors cannot fully explain the dramatic biological and cultural events that occurred during this time period
Impacts des changements globaux sur la distribution des poissons migrateurs amphihalins : une approche par modélisation à l'échelle continentale by Géraldine Lassalle( Book )

2 editions published in 2008 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Les poissons migrateurs amphihalins évoluent dans un environnement qui est perturbé, à l'échelle globale, par le changement climatique et à l'échelle régionale, par les pressions anthropiques telles que les barrages et la pollution des cours d'eau. Cette étude, menée à l'échelle continentale, avait pour objectif d'évaluer, de comprendre et de prédire les impacts de changements globaux sur la distribution de ce groupe. Afin de répondre à cette problématique, des modèles empiriques de distribution ont été construits pour chacune des 28 espèces étudiées. Leurs distributions ont été décrites au début et à la fin du XXème siècle, en termes de présence-absence et de classes d'abondance. Les variables explicatives potentielles étaient de type physique, climatique, biotique et anthropique. Dans un premier temps, il a été mis en évidence que la répartition vers 1900 des poissons migrateurs amphihalins était fortement contrainte par leur histoire biogéographique et par les conditions thermiques et hydrauliques de l'habitat continental. La projection de ces distributions, à la fin du XXIème siècle, dans le contexte du changement climatique, a montré la forte sensibilité de ce groupe aux modifications du climat. Bien que spécifiques à chaque espèce, les réponses ont pu être classées en trois catégories : expansion de l'aire de répartition, contraction de l'aire de répartition et peu ou pas de changement. Dans un deuxième temps, pour la première fois à l'échelle continentale, l'importance des grands barrages et de la densité de populations humaines pour expliquer la distribution actuelle de ces espèces a été démontrée. Les relations sont apparues complexes et dépendantes des caractéristiques écologiques des espèces, notamment de la position de leurs habitats de croissance et de reproduction le long du réseau hydrographique et de leur place au sein du réseau trophique
Pratiques funéraires et identités biologiques à Berytus et à Botrys à l'époque romaine (Liban, Ier siècle av. J.-C. - IVème siècle apr. J.-C.) by Nada Elias( )

2 editions published in 2016 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

During the first century B.C., with the rise of the Roman Empire, the Levant became the scene of cosmopolitanism where many heteroclite cultures would coexist. The new cosmopolitan society had Rome as its capital (Caput Mundi), and roads drawn up by the army linking the rest of the empire to its capital. Recent rescue excavations (since 2005) in Berytus (Beirut) and Botrys (Batroun) have revealed a considerable amount of unpublished data on populations who lived in the region during the four centuries of the Roman Empire until the early centuries of Christianity. Following an archaeo-anthropological approach, this thesis presents an assessment of eight funerary sites (n= 290) from the cities of Colonia Julia Augusta Felix Berytus and Botrys. Significantly, Botrys, unlike Berytus, did not have the status of a Roman colony. This research seeks to contribute to the history of these two cities. The purpose is to understand the populations of the past through the study of the skeletons, rituals and funerary practices as well as the organisation of funerary spaces. This study primarily reveals a cultural and biological cosmopolitanism illustrated by variability in funerary practices and in biological characteristics. These results suggest that at least two different groups or more coexisted in the Colonia Julia Augusta Felix Berytus. On the contrary, the biocultural data of Botrys skeletons reveal a less cosmopolitan city with less diversity shown on different anthropological and cultural levels. Indeed, the similarity of funerary practices, body treatments, grave goods and the organisation of the funerary space and biological homogeneity are indisputable in Botrys. Comparative analysis between Berytus and Botrys highlighted an existing biological heterogeneity at different scales between individuals of both cities. However, this diversity is contradicted by the homogeneity of the females of both cities during the 2th and the 4th century A. D
Évaluation de l'état écologique des plans d'eau aquitains à partir des communautés de producteurs primaires by Maria Cellamare( )

1 edition published in 2009 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

En raison de leur importante capacité de réponse aux changements environnementaux, les producteurs primaires sont depuis longtemps utilisés comme indicateurs biologiques de la qualité des milieux aquatiques. La Directive Cadre Européenne sur l'Eau (2000/60/CE) préconise ainsi l'utilisation du phytoplancton, du phytobenthos et des macrophytes afin de mesurer l'état écologique des écosystèmes lacustres. Dans cette étude, ces trois compartiments ont été utilisés pour déterminer l'état écologique de cinq lacs localisés dans la région Aquitaine (Sud-Ouest de la France), lacs ayant la particularité de présenter des niveaux trophiques différents. Les résultats ont montré qu'au niveau intra-lac la composition floristique dépend fortement des variables physiques dans la plupart des systèmes tandis qu'au niveau inter-lac celle-ci dépend du niveau trophique. Le phytoplancton s'est révélé être l'indicateur de qualité le plus performant et le seul utilisable dans les eaux ouvertes, et le plus précis dans les systèmes où les macrophytes submergés étaient absents. Cependant, dans les lacs humiques, les assemblages phytoplanctoniques semblent répondre davantage à la turbidité et aux brassages fréquents de la colonne d'eau qu'aux nutriments. Dans de telles conditions, afin de mieux caractériser la qualité de l'eau, l'utilisation complémentaire du phytobenthos et des macrophytes se révèle plus pertinente. En conclusion, considérant les trois compartiments biologiques, la présente étude permet une approche complémentaire de l'état écologique des systèmes lacustres. Certaines des méthodes appliquées ici représentent un outil potentiel de détermination de la qualité de l'eau selon les exigences de la DCE, mais elles nécessitent d'être affinées pour une meilleure évaluation de l'état écologique des lacs français. Une attention particulière a été portée aux taxa exotiques observés dans ces lacs tempérés, et cet aspect doit être pris en considération lors de l'évaluation écologique. En effet, ces espèces sensiblement avantagées par les conséquences du changement climatique, peuvent altérer la structure et le fonctionnement des écosystèmes aquatiques en place, et aboutir à une perte de diversité
Mathématiques et politiques scientifiques en Saxe (1765-1851) : institutions, acteurs et enseignements by Thomas Morel( )

1 edition published in 2013 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

This work aims at studying the evolutions of mathematics in the state of Saxony between 1765 and 1851. By studying the social and institutional transformations of this discipline, we show that this epoch, far from being a minor period for German mathematics, is full of thinkings about its goals and methods. A particular attention is given to the reforms of scientific and technical institutions in which mathematics are used, particularly the universities of Leipzig and Wittenberg, the mining academy of Freiberg and the polytechnic school of Dresden. Institutions archive as well as a detailed biographical study of mathematicians allow for the analysis of the actual scientific policies and their influence on the development of the mathematical sciences in Saxony
Trajectoire de restauration des marais intertidaux : réponse du necton à la dépoldérisation dans l'estuaire de la Gironde by Alain Lechêne( )

1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

European intertidal marshes have greatly declined during the past centuries because of land claim andhave recently been threatened by the effects of climate change. In recent years, an increasing number of tidal resto-ration projects have been implemented, following a global trend termed de-embankment. This thesis describes therestoration trajectory of tidally restored marshes from the response of nekton (i.e., fish and decapod crustaceans)based on two storm-breached study sites in the Gironde estuary : the Mortagne marsh and the Nouvelle island.Nekton assemblage composition of tidally restored marshes was described through a whole-estuary approach en-compassing natural, restored and dyked habitats. Nekton assemblages of tidally restored marshes showed highcompositional similarity with natural intertidal habitats and greatly departed from dyked marshes. Dyked marsheswere characterized by high occurrence of freshwater exotic taxa. Tidally restored marshes seemed particularly at-tractive for the thin-lipped grey mullet, Liza ramada. The functional traits' distribution within fish communities revealeda change in functional structure in the course of restoration using the naturalness state of habitats as a proxy forrestoration time. Most notably, functional specialization, dispersion and richness increased with restoration time.No clear pattern of change was observed in community assembly over time ; trends chiefly varied with respect totraits. Temporal trends in one of the restored sites revealed three phases in the first four years of tide restoration.The abundance of several species and the community functional structure changed more steeply in the midst ofthe second phase, less than two years following tide restoration. Community turnover was probably delayed dueto incomplete drainage of the site in the early stages of restoration. The results of this thesis lead to a better un-derstanding of the restoration trajectory of tidal marshes without human intervention and highlight the strengths andweaknesses of some theoretical models used in restoration ecology
Sensibilité et adaptation de populations de bivalves marins soumis à des stress multiples : infestation parasitaire, contamination microbienne et pollution métallique by Ika Paul-Pont( )

1 edition published in 2010 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

In coastal ecosystems, man-mediated activity and natural context induce a ?multistress? situation in aquatic organisms. Amongst potential perturbation sources, three of them were studied: metal contamination, bacterial infection and parasite infestation. An integrated approach of their interactions on genetic, protein, cellular and population dynamics responses in the cockle (Cerastoderma edule) and the Manila clam (Ruditapes philippinarum) was undertaken through field and laboratory studies. A two-years monitoring was conducted in four bivalve populations from different environments to estimate the fitness of populations (parameters of population dynamics), in relation with the baseline levels of stressors (metals, parasites) and with the adaptive responses implemented by bivalves in terms of detoxification and immunity. This approach allowed describing different scenarii concerning the relationship between bivalve populations and their environment. In laboratory, co-infection experiments (trematode parasite Himasthla elongata, bacteria Vibrio tapetis) were conducted on these populations in controlled condition with or without metal contamination (cadmium). They showed that the response of bivalves to stress is species-dependent. Combinations were not intuitively deduced from the "mono - stress" responses underscoring the concept of interactions. Despite the complexity and diversity of these interactions, some mechanisms predominated regardless of the studied species. While parasite infestation was not modulated by the presence of metal or bacteria in the environment, metal bioaccumulation in turn was strongly influenced by the presence of one or several pathogens. Beyond disrupting the accumulation of pollutants, the presence of pathogens interfered with the cellular detoxification mechanisms including impairment of the metallothionein (MT) synthesis. A focus on the response of MT in cockles exposed to a metal through the expression of isoform Cemt1 and protein synthesis confirmed the complementary of these observations (gene and protein). They also highlighted the need to analyze responses at different scales to obtain an overview of existing interactive process between pollutants and pathogens. Strong interactions were found: ?Cd x parasite? in the cockle and" bacteria x parasite "in the clam, at the genetic, protein and immune levels. Finally, these experiments highlighted the important role of life history on the sensitivity of organisms to pollutant-pathogen interactions
Dynamique d'hybridation dans le complexe d'espèces des chênes blancs européens : chênes pédonculés - Quercus robur L., sessiles - Q. petraea (Matt.) Liebl., pubescents - Q. pubescens Willd. et tauzins - Q. pyrenaica Willd by Olivier Lepais( )

1 edition published in 2008 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

L'hybridation est un processus aux conséquences diverses sur l'évolution des espèces qui est difficile à étudier lorsque les espèces se distinguent mal au niveau morphologique. Afin de comprendre le rôle de l'hybridation dans l'évolution du complexe d'espèces des chênes blancs européen, nous avons utilisé des outils de la génétique des populations pour quantifier les flux de gènes interspécifiques contemporains et étudier le système de reproduction de quatre espèces. Un protocole d'analyse génétique rapide a été développé et des méthodes d'assignations génétiques, permettant de déterminer l'espèce de chaque arbre et d'identifier les hybrides, ont été testées par simulations. Cette méthode a été appliquée en populations naturelles révélant un pourcentage d'hybrides variant de 10 à 30% en fonction des populations et impliquant tous les couples d'espèces. Nous avons montré que les effectifs des espèces dans les parcelles influencent la dynamique d'hybridation et la directionalité de l'introgression. Nous avons étudié le système de reproduction de ces espèces en croisements contrôlées et en forêt pour expliquer le maintien des espèces malgré la présence de flux de gènes interspécifiques. L'existence de plusieurs barrières reproductives contribue à un isolement partiel des espèces qui dépend principalement de barrières pré-reproductives et prézygotiques. Une analyse de paternité pratiquée sur des descendances récoltées en forêt montre que l'hybridation de première génération est rare mais que ces hybrides F1 sont fertiles et se reproduisent principalement avec l'une des espèces parentales, produisant de nombreux rétrocroisements qui expliquent le fort pourcentage d'hybrides observé dans les populations naturelles étudiées. L'hybridation et l'introgression sont donc des processus à l'œuvre chez les chênes qui contribuent à l'évolution du complexe d'espèces
Niche écologique de l'alose pendant la reproduction : conséquences au niveau de la population dans un contexte de dérèglement climatique by Alexis Paumier( )

1 edition published in 2019 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

This PhD takes place in a context of climate change (IPCC 2018) and a general decline in fish species. The objective of this PhD thesis was to define environmental control over the reproduction of the allis shad. Using 4 main studies with several modelling tools (Manly index, BRT model, HoOS model and flirtyShadBrain model), we studied this environmental control and assessed the future impact of climate change.The first step in assessing the impact of habitat changes was to test the influence of environmental factors on shad reproduction (paper #1, paper #2 and the flirtyShadBrain model). We first explored the influence of temperature, then tested several environmental factors on shad reproduction. In practice, we evaluate that the shad is a photoperiodic species. Day length may be the seasonal data that triggers migration, and temperature and flow are used for short-term decisions (final choice to reproduce with social benchmarks). We used this knowledge to explore the potential impact of climate change. According to our multifactorial projections, it would appear that allis shad spawners will not be affected by future global warming for the RCP 2.6 scenario, and that even in the worst case scenario (RCP 8.5), habitat favorability should even increase, although with an earlier favourable period. Thus, climate change does not appear to be a major threat to this species
Modélisation des processus biogéochimiques dans les sédiments variablement saturés soumis au forçage de la marée by Romain Chassagne( )

1 edition published in 2010 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

For a better understanding of the complexity of the biogeochemical processes in coastal re-gion, a 2D model has been developed. This model couples hydrodynamic forcing generated bythe tide and the transport-reaction processes of biogeochemical species. Di- scharge of the tideinto the variably-saturated porous media is modelled by Richards equation. Some numerical me-thods are required for solving this kind of complex problem, as Streamline Upwind Petrov Galerkin(SUPG) method and shock capturing method. The highly dynamical site of the Truc-Vert beach hasbeen chosen as reference field, mainly because of avalaible biogeochemical and hydrodynamicalstudies. The input parameters of the model come from these field data (ANR PROTIDAL and MO-BISEA projects) and from the bibliography. The validation of the model was made in regards oftwo case studies from published hydrodynamic simu- lations under tidal forcing and from avaliabletransport-reaction solutions. A first version of the model has been declined to describe silicic acidevolution into porous media under tidal forcing. The flux of the silicic acid to the ocean and theresidence time of silicic acid into permeable sandy sediments were estimated. After some days, weobserve the formation of a lens of low silicic acid concen- tration in the upper part of the intertidalzone. This lens is the main imprint of the tidal forcing. We studied also variations of the lens geo-metry and the residence time under influence of model parameters, such as the beach slope, the tideamplitude and the dispersion coefficient. A second version of the model describes the organic mat-ter degradation , and simulates the concentrations of oxygen, nitrates and phosphates. The modelreproduces the spatial (2D) and temporal distribution of the concentration of these different che-mical species into the sediment. Nowadays environmental problems are fondamental for our societyand the understanding of the sediment-ocean interactions is a crucial step. The new model allowsus a better understanding of the tidal impact on biogeochemical processes in permeable sediments and offers a quantitative approach on biogeochemical processes that occur into variably-saturatedsandy sediments. The model also offers a useful tool to optimize sampling strategy for field studies
The early Upper Paleolithic of Zagros : techno-typological assessment of three Baradostian lithic assemblages from Khar Cave (Ghar-e Khar), Yafteh Cave and Pa-Sangar Rockshelter in the Central Zagros, Iran by Sonia Shidrang( )

1 edition published in 2015 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

The Middle to Upper Paleolithic transition is an intensely debated topic in Paleolithicarchaeology and paleoanthropology of Western Asia. The disappearing of Neanderthals and the widespread expansion of anatomically modern humans as well as the emergence of Early Upper Paleolithic technologies in Europe and Southwest Asia are just some of the enigmatic aspects of this transitional period which occurred during Marine Isotope Stage 3.The level of our knowledge on the subject of Middle to Upper Paleolithic transitional events is not the same in all regions of Southwest Asia. This thesis presents a synthesis of the EarlyUpper Paleolithic lithic industries of Central Zagros or Baradostian as an important part of the material culture related to this crucial stages of human evolution in western part of Iran. It reviews most important parts of the EUP related data from this region and examines the lithic-based dominant hypothesis of continuity in the Zagros through a moretechnology oriented view and put together all the evidence to present a broader overview of the Early Upper Paleolithic in Zagros and its lithic industrial evolution. Incorporating new information from typo-technological and taphonomical studies of three Baradostian assemblages from Khar cave (Ghar-e Khar), Yafteh cave and Pa-Sangar rockshelter into the existing knowledge, this thesis provides us with a better reconstruction of the Baradostain sequence in the Zagros
Restauration écologique des prairies alluviales par transfert de matériel biologique : importance des premières étapes sur les trajectoires des communautés végétales. by Myriam Garrouj( )

1 edition published in 2019 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les prairies humides alluviales abritent une faune et une flore originales et diversifiées du fait de leur hétérogénéité spatio-temporelle et apportent de nombreux services aux êtres humains (services écosystémiques).Pourtant, ces milieux qui résultent d'activités agricoles traditionnelles sont soumis à divers types de menaces, telles que l'urbanisation ou l'intensification des activités agricoles, associées au drainage ou à la mise en culture et au labour. Ces écosystèmes sont également soumis à des modifications des processus de dispersion des espèces. Dans un contexte de régression des zones humides au niveau mondial et national, l'enjeu de conservation et de restauration de certains sites doit s'accompagner d'une connaissance approfondie du fonctionnement de ces milieux.L'écologie de la restauration est une discipline basée sur les théories et les concepts fondamentaux de l'écologie des communautés, fonctionnelle et du paysage. Les connaissances en découlant permettent la définition de protocoles de gestion des milieux. L'écologie de la restauration constitue en retour un moyen de tester les concepts d'écologie fondamentale. Parmi les processus qui entrent en jeu dans l'assemblage d'une communauté, les filtres écologiques (de dispersion, environnementaux et de co-existence) occupent un rôle clé. Leur compréhension est nécessaire pour l'atteinte des objectifs de restauration écologique.Sur la base des approches issues des assemblages des communautés végétales, cette thèse a permis d'identifier des processus intervenant dans les premières phases de restauration écologique des prairies alluviales. Nous avons ainsi pu approfondir les connaissances relatives à la préparation des conditions initiales via un travail du sol, aux effets des types d'apport biologique, de plus en plus complets, et au rôle de la gestion sur les trajectoires des cortèges floristiques au cours des premières années de restauration écologique.Premièrement, nos résultats tendent à soutenir le fait qu'une préparation des conditions initiales du milieu à restaurer favorisait l'installation des espèces végétales cibles. En revanche, cette préparation ne semble pas nécessiter une intervention lourde (comme un labour profond du sol). Des interventions plus légères, comme une fauche et un hersage, semblent suffisants pour permettre le recrutement et l'installation des espèces cibles. Ensuite, nos résultats ont montré que le transfert de matériel biologique, qu'il s'agisse d'un semis de graines, de transfert de foin ou de transfert de blocs de sol, permettait de contourner la limitation de dispersion et de disponibilité des graines des espèces cibles des prairies humides alluviales, vérifiant les résultats observés dans la littérature. De faibles différences ont néanmoins été détectées entre les types de matériel biologique transféré, mais nécessiteraient des investigations à plus long terme pour être confirmées. Enfin, nos observations ont permis d'apporter des éléments sur les effets de la gestion sur les trajectoires des communautés végétales lors des toutes premières phases de restauration. Ainsi, le maintien d'une perturbation mécanique sur des périodes adaptées permet de renforcer la dynamique des communautés vers celles de la référence.Les acteurs de la société (politiques, gestionnaires) sont de plus en plus impliqués dans la mise en place de programmes de restauration et toutes ces connaissances nous ont permis d'apporter des éléments concrets pour la restauration des prairies humides alluviales
Interaction between tree diversity and water availability on nutrient cycling in forests by Tania Maxwell( )

1 edition published in 2021 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Increasing biodiversity has been highlighted as a solution to make forests more efficient and resilient to global changes, such as drought. In this thesis, we sought to determine whether reduced water availability could have an impact on the potential effects of tree species diversity on nutrient cycling. To answer this, two experimental sites (France and Canada) that manipulate both tree diversity and water were studied. We observed that surface soil biogeochemical processes were driven by water availability, intermediate soil processes by species mixing, and nutrient use efficiency by species identity. Finally, we did not observe an interactive effect between these factors, as they were spatially and temporally separated
Description et étiologie des exostoses oro-faciales : exemple d'une population thaïlandaise by Anneliese Léonard( )

1 edition published in 2014 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

We aim here at participating in a better understanding of oral exostoses as an anatomical variant in order to clarify their possible use in biological anthropology. We propose a new study design that could be applied both on skeletal remains and living individuals and that allows discuss the etiology of oral exostoses. The research has been undertaken on the anatomical reference collection of the faculty of medicine of Chiang Mail, Thailand. The Thai population displays a wide array of expression of oral exostoses and a great genetic homogeneity. The oral exostoses have been scored by presence/absence and their measurements. The genetic component has been evaluated through population homogeneity and the relationships between oral exostoses and dental and cranial anatomical variants. The environmental component includes data on diet, occlusal stress and oral health. Oral exostoses appear as a set of characters linked together and strongly influenced by age. All types of oral exostoses except the palatine exostosis are correlated with sex with a male predominance. Oral exostoses do not belong to hyperostotic variants. The recurring relationships with dental anatomical traits point to a genetic basis. Oral exostoses preferentially arise when the greatest number of healthy, unworn teeth is present, although extensive edentulousnes does not lessen both their presence and their expressivity. The local environmental context is not typical of functional stress. The traditional Asian diet may be a substantial influence because of its bone-promoting composition. A dual participation of both genetic and environmental components to the etiological process implies that oral exostoses are quasi-continuous variants
Variabilité et signification des productions lithiques au Paléolithique moyen ancien : l'exemple de trois gisements de plein-air du Bergeracois (Dordogne, France) by Michel Brenet( )

1 edition published in 2011 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Variabilité et signification des productions lithiques au Paléolithique moyen ancien. L'exemple de trois gisements de plein-air du Bergeracois (Dordogne, France).Dès le début de l'Avant-dernier Interglaciaire, les industries lithiques témoignent d'un foisonnement des conceptions, méthodes et techniques de production : débitages Levallois, Discoïde ou SSDA, débitages laminaires, débitage sur enclume, et façonnage de pièces individualisées ou selon des techno-types. Cette diversité des conceptions de production lithique s'affirme parfois au sein des ensembles archéologiques avec la coexistence de chaînes opératoires de débitage et de façonnage bien différenciées ; une conception de production combinée associant débitage et façonnage sur les mêmes matrices a en particulier été décrite dans plusieurs assemblages. Ce travail aborde la problématique de la variabilité inter et intra-site et de sa signification comportementale par le biais de l'analyse techno-économique des industries et de la démarche expérimentale. Pour neuf ensembles lithiques issus de trois gisements du Bergeracois, Cantalouette 1, Combre Brune 2 et Combe Brune 3, chacune des méthodes de production est traitée en évaluant quantitativement toutes les phases opératoires présentes depuis l'approvisionnement en matière première lithique jusqu'à l'utilisation des produits. L'expérimentation s'inscrit dans cette démarche par l'apport de référentiels spécifiques destinés à être comparés aux ensembles lithiques afin de mieux estimer leur représentativité techno-économique.L'objectif est in fine de proposer des modèles cohérents de fonctionnement des occupations humaines au début du Paléolithique moyen en regard de leur implantation et complémentarité potentielle au sein d'un même territoire de subsistance habité et parcouru. Les natures respectives des occupations dont témoignent les trois sites de l'étude sont ainsi modélisées et comparées aux statuts d'autres sites localisés en Dordogne et dans d'autres régions
Paléohydrologie de surface des mers nordiques à l'Holocène terminal (derniers 3000 ans) : le message du phytoplancton à squelette calcaire et organique by Christian Dylmer( )

1 edition published in 2013 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

La variabilité de l'intensité du flux d'eaux atlantiques et de la nature des masses d'eau de surface le long des marges occidentales de la Norvège, de la mer de Barents et du Svalbard a été reconstituée sur la base des assemblages de coccolithes et dinokystes présents dans cinq carottes sédimentaires marines représentatives de l'Holocène terminal. Les résultats sont présentés sous la forme de reconstructions qualitatives et quantitatives (fonctions de transfert MAT) à haute résolution temporelle (échelle décennale à sub-séculaire). Un travail visantà valider les traceurs micropaléontologiques utilisés a été réalisé en parallèle à l'objectif principal, et s'est en particulier nourri de la collecte et de l'examen de populations vivantes distribuées le long de plusieurs transectszonaux en mer de Norvège, mer d'Islande et à travers le détroit de Fram.Nos résultats indiquent que la partie orientale des mers Nordiques (66 à 77°N) a été sujette à une tendance globale à l'augmentation du flux d'eaux atlantiques (AW) au cours des derniers 3000 ans. La dynamique récente de ce flux méridien est supposée répondre à la modulation long-terme de la force et de la localisation de la ceinture des vents d'ouest qui est essentiellement pilotée par l'Oscillation Nord Atlantique. Ce même mécanisme atmosphérique réconcilie le déplacement zonal et contradictoire du front arctique entre le domaine ouest-norvégien, et les façades occidentales de la mer de Barents et du détroit de Fram. La variabilité rapide du flux d'AW reproduit la succession des phases climatiques historiques classiques chaudes (Période Chaude Romaine, Période Chaude Médiévale, Période Moderne : flux accentué d'AW) et froides (Période Sombre, Petit Age Glaciaire : flux réduit d'AW) des derniers 2500 ans. Un événènement rapide de renforcement du flux d'AW en mers Nordiques a été identifié pendant le Petit Age Glaciaire entre 330 et 410 ans BP (cal.). Nos résultats indiquent que les variations d'intensité du flux d'AW vers l'Océan Arctique ont eu un impact majeur sur la distribution de la glace de mer arctique au cours du dernier millier d'années, les variations reconstruites de l'extension du couvert de glace à l'echelle de l'océan arctique étant parfaitement corrélées (échelle subséculaire) avec nos reconstructions qualitatives de la dynamique de l'AW au large du Svalbard et de la mer de Barents. La diminution importante de l'extension de la banquise durant le 20ème siècle est synchrone d'un flux record d'AW à travers le détroit de Fram, flux qui, d'après nos données, est sans précédent pour les derniers 3000 ans
 
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