Prangé, Thierry
Overview
| Works: | 10 works in 17 publications in 2 languages and 25 library holdings |
|---|---|
| Roles: | Thesis advisor, Contributor, Author |
| Classifications: | QH345, 570 |
Publication Timeline
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Most widely held works by
Thierry Prangé
Synthèse et structures moléculaires d'acides hydroxy-bisphosphoniques, dihydroxy-tetraphosphoniques et de leurs complexes
cationiques by
Mounya Coindet Benramdane(
Book
)
3 editions published in 1996 in French and held by 4 WorldCat member libraries worldwide
Ce mémoire de thèse porte sur la synthèse de l'acide dihydroxy-tétraphosphonique C6H4-[(H2O3P)C(OH)(PO3H)]2 et l'étude structurale par diffraction des rayons X de quatre composés hydroxy-bisphosphoniques et trois dihydroxy-tétraphosphoniques : l'acide 6-amino 1 hydroxy hexylidène 1, 1' -bisphosphonique (HHBP 5N) qui a cristallisé sous une nouvelle variété polymorphique, le sel complexe de cadmium de l'acide (HBBP 3N) dans lequel les polyèdres de coordination se présentent sous la forme de bioctaèdres discrets à arête commune, l'acide 1-hydroxy pentylidène 1,1'-bisphosphoniques (HPBP) et l'acide 1,8-dihydroxy octylidène 1,1', 8,8'-tétraphosphonique (DHOTP) qui sont en réalité des sels de diméthyl oxonium. Ces deux sels qui ont été isolés dans l'état solide se présentent donc comme des édifices stables. Les interactions de Van Der Waals auxquelles s'ajoutent les interactions de type coulombienne entre groupes chargés et les liaisons hydrogène, induisent respectivement des zones hydrophobes et des zones hydrophiles, qui contribuent à la grande stabilité de l'édifice cristallin. Et enfin, les sels complexes de cuivre et de calcium de l'acide DHOTP. La coordination est pyramidale à base carrée pour le cuivre et octaédrique pour le calcium. Les polyèdres de coordination, dans les deux cas, s'organisent en chaînes polymères. L'étude de la coordination des cations polyèdres, du mode d'ancrage sur le groupe hydroxy-bisphosphonique et de la géométrie de la molécule d'acide des composés cités ci-dessus et ceux de la littérature, a fait l'objet d'une comparaison puis d'une classification en fonction de la nature des interactions présentes au sein des différentes structures. Elle a aussi montré que ces différents facteurs structuraux sont des facteurs de grande stabilité qui président à l'organisation en phase solide des composés hydroxy-bisphosphoniques et dihydroxy-tétraphosphoniques
3 editions published in 1996 in French and held by 4 WorldCat member libraries worldwide
Ce mémoire de thèse porte sur la synthèse de l'acide dihydroxy-tétraphosphonique C6H4-[(H2O3P)C(OH)(PO3H)]2 et l'étude structurale par diffraction des rayons X de quatre composés hydroxy-bisphosphoniques et trois dihydroxy-tétraphosphoniques : l'acide 6-amino 1 hydroxy hexylidène 1, 1' -bisphosphonique (HHBP 5N) qui a cristallisé sous une nouvelle variété polymorphique, le sel complexe de cadmium de l'acide (HBBP 3N) dans lequel les polyèdres de coordination se présentent sous la forme de bioctaèdres discrets à arête commune, l'acide 1-hydroxy pentylidène 1,1'-bisphosphoniques (HPBP) et l'acide 1,8-dihydroxy octylidène 1,1', 8,8'-tétraphosphonique (DHOTP) qui sont en réalité des sels de diméthyl oxonium. Ces deux sels qui ont été isolés dans l'état solide se présentent donc comme des édifices stables. Les interactions de Van Der Waals auxquelles s'ajoutent les interactions de type coulombienne entre groupes chargés et les liaisons hydrogène, induisent respectivement des zones hydrophobes et des zones hydrophiles, qui contribuent à la grande stabilité de l'édifice cristallin. Et enfin, les sels complexes de cuivre et de calcium de l'acide DHOTP. La coordination est pyramidale à base carrée pour le cuivre et octaédrique pour le calcium. Les polyèdres de coordination, dans les deux cas, s'organisent en chaînes polymères. L'étude de la coordination des cations polyèdres, du mode d'ancrage sur le groupe hydroxy-bisphosphonique et de la géométrie de la molécule d'acide des composés cités ci-dessus et ceux de la littérature, a fait l'objet d'une comparaison puis d'une classification en fonction de la nature des interactions présentes au sein des différentes structures. Elle a aussi montré que ces différents facteurs structuraux sont des facteurs de grande stabilité qui président à l'organisation en phase solide des composés hydroxy-bisphosphoniques et dihydroxy-tétraphosphoniques
CRISTALLOGENESE DU BPTI A PH ACIDE : ETUDE DES RELATIONS ENTRE L'ETAT D'ASSOCIATION DES MOLECULES EN SOLUTION ET A L'ETAT
CRISTALLIN PAR DIFFUSION ET DIFFRACTION DES RAYONS X by CYRIL HAMIAUX(
Book
)
2 editions published in 2000 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
LA CRISTALLISATION DES PROTEINES EST UN PHENOMENE DE TRANSITION DE PHASE LIQUIDE/SOLIDE ENCORE MAL COMPRIS, D'UNE PART PARCE QUE LES PROTEINES SONT DES OBJETS COMPLEXES, COMPORTANT PLUSIEURS MILLIERS D'ATOMES ET PRESENTANT TRES PEU DE SYMETRIE, ET D'AUTRE PART, PARCE QU'IL EST INDISPENSABLE DE LES CONSERVER, MEME AU SEIN DU CRISTAL, DANS UN ENVIRONNEMENT PROCHE DE LEUR ENVIRONNEMENT PHYSIOLOGIQUE (AQUEUX POUR LES PROTEINES SOLUBLES). AU COURS DE NOTRE ETUDE, NOTRE ATTENTION S'EST PORTEE SUR LA CRISTALLISATION, A PH ACIDE, D'UNE PETITE PROTEINE BASIQUE, LE BPTI (BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR), EN PRESENCE DE THIOCYANATE DE POTASSIUM, DE CHLORURE DE SODIUM ET DE SULFATE D'AMMONIUM. L'EVOLUTION DE CE SYSTEME AU COURS DE SA TRANSITION DE PHASE (DEPUIS LA SOLUTION JUSQU'A L'ETAT CRISTALLIN) A ETE SUIVIE ET CARACTERISEE AU NIVEAU ATOMIQUE ET MOLECULAIRE, GRACE A LA COMPLEMENTARITE DE TROIS TECHNIQUES D'ANALYSE : LA DIFFRACTION DES RAYONS X, LA DIFFUSION DES RAYONS X AUX PETITS ANGLES (DXPA) ET LA FILTRATION SUR GEL. L'ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE A PERMIS DE CARACTERISER L'ETAT FINAL DU SYSTEME : LES CRISTAUX. NOUS AVONS MIS EN EVIDENCE QUE LES TROIS FORMES CRISTALLINES DIFFERENTES OBTENUES SELON LES CAS, PRESENTENT UN MOTIF COMMUN SOUS LA FORME D'UN DECAMERE DE BPTI. PAR LA SUITE, NOUS AVONS PU MONTRER, PAR DES ETUDES COUPLEES PAR DXPA ET PAR FILTRATION SUR GEL, EN UTILISANT LES RESULTATS CRISTALLOGRAPHIQUES OBTENUS PRECEDEMMENT, QU'UN PHENOMENE D'OLIGOMERISATION DES MOLECULES AVAIT LIEU EN SOLUTION, AVANT LA NUCLEATION, ET QUE LES PARTICULES FORMEES N'ETAIENT AUTRES QUE LES DECAMERES OBSERVES DANS LES DIFFERENTES FORMES CRISTALLINES. CES RESULTATS SUGGERENT ALORS UN MECANISME A DEUX ETAPES POUR LA CRISTALLISATION DU BPTI : FORMATION PUIS EMPILEMENT DES DECAMERES. AU TERME DE CETTE ETUDE, CE SYSTEME, AU COMPORTEMENT INATTENDU ET PRESENTANT PLUSIEURS AUTRES CARACTERISTIQUES INTERESSANTES, A VOCATION A JOUER UN ROLE DE SYSTEME MODELE POUR L'ETUDE DE LA CRISTALLOGENESE
2 editions published in 2000 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
LA CRISTALLISATION DES PROTEINES EST UN PHENOMENE DE TRANSITION DE PHASE LIQUIDE/SOLIDE ENCORE MAL COMPRIS, D'UNE PART PARCE QUE LES PROTEINES SONT DES OBJETS COMPLEXES, COMPORTANT PLUSIEURS MILLIERS D'ATOMES ET PRESENTANT TRES PEU DE SYMETRIE, ET D'AUTRE PART, PARCE QU'IL EST INDISPENSABLE DE LES CONSERVER, MEME AU SEIN DU CRISTAL, DANS UN ENVIRONNEMENT PROCHE DE LEUR ENVIRONNEMENT PHYSIOLOGIQUE (AQUEUX POUR LES PROTEINES SOLUBLES). AU COURS DE NOTRE ETUDE, NOTRE ATTENTION S'EST PORTEE SUR LA CRISTALLISATION, A PH ACIDE, D'UNE PETITE PROTEINE BASIQUE, LE BPTI (BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR), EN PRESENCE DE THIOCYANATE DE POTASSIUM, DE CHLORURE DE SODIUM ET DE SULFATE D'AMMONIUM. L'EVOLUTION DE CE SYSTEME AU COURS DE SA TRANSITION DE PHASE (DEPUIS LA SOLUTION JUSQU'A L'ETAT CRISTALLIN) A ETE SUIVIE ET CARACTERISEE AU NIVEAU ATOMIQUE ET MOLECULAIRE, GRACE A LA COMPLEMENTARITE DE TROIS TECHNIQUES D'ANALYSE : LA DIFFRACTION DES RAYONS X, LA DIFFUSION DES RAYONS X AUX PETITS ANGLES (DXPA) ET LA FILTRATION SUR GEL. L'ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE A PERMIS DE CARACTERISER L'ETAT FINAL DU SYSTEME : LES CRISTAUX. NOUS AVONS MIS EN EVIDENCE QUE LES TROIS FORMES CRISTALLINES DIFFERENTES OBTENUES SELON LES CAS, PRESENTENT UN MOTIF COMMUN SOUS LA FORME D'UN DECAMERE DE BPTI. PAR LA SUITE, NOUS AVONS PU MONTRER, PAR DES ETUDES COUPLEES PAR DXPA ET PAR FILTRATION SUR GEL, EN UTILISANT LES RESULTATS CRISTALLOGRAPHIQUES OBTENUS PRECEDEMMENT, QU'UN PHENOMENE D'OLIGOMERISATION DES MOLECULES AVAIT LIEU EN SOLUTION, AVANT LA NUCLEATION, ET QUE LES PARTICULES FORMEES N'ETAIENT AUTRES QUE LES DECAMERES OBSERVES DANS LES DIFFERENTES FORMES CRISTALLINES. CES RESULTATS SUGGERENT ALORS UN MECANISME A DEUX ETAPES POUR LA CRISTALLISATION DU BPTI : FORMATION PUIS EMPILEMENT DES DECAMERES. AU TERME DE CETTE ETUDE, CE SYSTEME, AU COMPORTEMENT INATTENDU ET PRESENTANT PLUSIEURS AUTRES CARACTERISTIQUES INTERESSANTES, A VOCATION A JOUER UN ROLE DE SYSTEME MODELE POUR L'ETUDE DE LA CRISTALLOGENESE
UTILISATION DU XENON ET DU KRYPTON POUR LA RESOLUTION DU PROBLEME DES PHASES PAR LES METHODES DU REMPLACEMENT ISOMORPHE ET
DE LA DIFFUSION ANOMALE by
MARC SCHILTZ(
Book
)
2 editions published in 1997 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
LE TRAVAIL DE THESE DECRIT L'UTILISATION DU XENON ET DU KRYPTON POUR LA RESOLUTION DU PROBLEME DES PHASES EN CRISTALLOGRAPHIE BIOLOGIQUE PAR LES METHODES DU REMPLACEMENT ISOMORPHE ET DE LA DIFFUSION ANOMALE. LA RADIOCRISTALLOGRAPHIE CONSTITUE UNE TECHNIQUE PUISSANTE POUR VISUALISER LES COMPOSANTS BIOCHIMIQUES DE BASE AU NIVEAU MOLECULAIRE ET ATOMIQUE. CETTE METHODE PHYSIQUE REPOSE SUR LA DIFFRACTION DES RAYONS X PAR UN CRISTAL QUI EST CONSTITUE DES MOLECULES QUE L'ON CHERCHE A ETUDIER. A L'HEURE ACTUELLE, DEUX OBSTACLES MAJEURS PERSISTENT TOUJOURS DANS CE DOMAINE : LES DIFFICULTES POUR OBTENIR DES CRISTAUX ET LE PROBLEME DES PHASES. C'EST DANS LE CADRE DE CETTE DERNIERE PROBLEMATIQUE QUE CE TRAVAIL DE RECHERCHE S'INSCRIT. PARTANT DES RESULTATS OBTENUS PAR DE NOMBREUSES ETUDES ANTERIEURES SUR L'INTERACTION DU XENON AVEC LES PROTEINES, L'UTILISATION DE CE GAZ POUR L'OBTENTION DE DERIVES ISOMORPHES EST ETUDIEE. UNE METHODE SIMPLE POUR LA PREPARATION DE DERIVES LOURDS AU XENON ET POUR LA COLLECTE DES DONNEES DE DIFFRACTION SOUS PRESSION DE GAZ A ETE MISE AU POINT. CETTE METHODE A ETE TESTEE SUR QUELQUES PROTEINES DE STRUCTURE CONNUE, AVANT D'ETRE APPLIQUEE AVEC SUCCES AUX PROBLEMES DE RESOLUTION DE PLUSIEURS STRUCTURES NOUVELLES. LES DERIVES OBTENUS SONT, EN GENERAL, HAUTEMENT ISOMORPHES DES STRUCTURES NATIVES CORRESPONDANTES. UN DEUXIEME ASPECT DU TRAVAIL CONCERNE L'ETUDE DES CARACTERISTIQUES PHYSICO-CHIMIQUES PLUS PROFONDES QUI CONDITIONNENT ET QUI REGISSENT LA FIXATION DU XENON PAR LES PROTEINES. EN PARTICULIER, LA GENERALITE DE LA FIXATION DES GAZ RARES DANS LE SITE ACTIF D'UNE CLASSE IMPORTANTE D'ENZYMES, LES PROTEASES A SERINE, EST MISE EN EVIDENCE. ENFIN, IL EST MONTRE QUE L'APPLICATION DU KRYPTON PERMET DE SURMONTER UN CERTAIN NOMBRE D'INCONVENIENTS LIES A L'UTILISATION DU XENON. EN CONCLUSION, L'ETUDE MONTRE QUE LE XENON ET LE KRYPTON PEUVENT ETRE UTILISES DE MANIERE PROFITABLE COMME ATOMES LOURDS ET DIFFUSEURS ANOMAUX ET FOURNISSENT DES RESULTAT STRUCTURAUX D'UNE TRES BONNE QUALITE
2 editions published in 1997 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
LE TRAVAIL DE THESE DECRIT L'UTILISATION DU XENON ET DU KRYPTON POUR LA RESOLUTION DU PROBLEME DES PHASES EN CRISTALLOGRAPHIE BIOLOGIQUE PAR LES METHODES DU REMPLACEMENT ISOMORPHE ET DE LA DIFFUSION ANOMALE. LA RADIOCRISTALLOGRAPHIE CONSTITUE UNE TECHNIQUE PUISSANTE POUR VISUALISER LES COMPOSANTS BIOCHIMIQUES DE BASE AU NIVEAU MOLECULAIRE ET ATOMIQUE. CETTE METHODE PHYSIQUE REPOSE SUR LA DIFFRACTION DES RAYONS X PAR UN CRISTAL QUI EST CONSTITUE DES MOLECULES QUE L'ON CHERCHE A ETUDIER. A L'HEURE ACTUELLE, DEUX OBSTACLES MAJEURS PERSISTENT TOUJOURS DANS CE DOMAINE : LES DIFFICULTES POUR OBTENIR DES CRISTAUX ET LE PROBLEME DES PHASES. C'EST DANS LE CADRE DE CETTE DERNIERE PROBLEMATIQUE QUE CE TRAVAIL DE RECHERCHE S'INSCRIT. PARTANT DES RESULTATS OBTENUS PAR DE NOMBREUSES ETUDES ANTERIEURES SUR L'INTERACTION DU XENON AVEC LES PROTEINES, L'UTILISATION DE CE GAZ POUR L'OBTENTION DE DERIVES ISOMORPHES EST ETUDIEE. UNE METHODE SIMPLE POUR LA PREPARATION DE DERIVES LOURDS AU XENON ET POUR LA COLLECTE DES DONNEES DE DIFFRACTION SOUS PRESSION DE GAZ A ETE MISE AU POINT. CETTE METHODE A ETE TESTEE SUR QUELQUES PROTEINES DE STRUCTURE CONNUE, AVANT D'ETRE APPLIQUEE AVEC SUCCES AUX PROBLEMES DE RESOLUTION DE PLUSIEURS STRUCTURES NOUVELLES. LES DERIVES OBTENUS SONT, EN GENERAL, HAUTEMENT ISOMORPHES DES STRUCTURES NATIVES CORRESPONDANTES. UN DEUXIEME ASPECT DU TRAVAIL CONCERNE L'ETUDE DES CARACTERISTIQUES PHYSICO-CHIMIQUES PLUS PROFONDES QUI CONDITIONNENT ET QUI REGISSENT LA FIXATION DU XENON PAR LES PROTEINES. EN PARTICULIER, LA GENERALITE DE LA FIXATION DES GAZ RARES DANS LE SITE ACTIF D'UNE CLASSE IMPORTANTE D'ENZYMES, LES PROTEASES A SERINE, EST MISE EN EVIDENCE. ENFIN, IL EST MONTRE QUE L'APPLICATION DU KRYPTON PERMET DE SURMONTER UN CERTAIN NOMBRE D'INCONVENIENTS LIES A L'UTILISATION DU XENON. EN CONCLUSION, L'ETUDE MONTRE QUE LE XENON ET LE KRYPTON PEUVENT ETRE UTILISES DE MANIERE PROFITABLE COMME ATOMES LOURDS ET DIFFUSEURS ANOMAUX ET FOURNISSENT DES RESULTAT STRUCTURAUX D'UNE TRES BONNE QUALITE
ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE DE L'INHIBITION REVERSIBLE ET IRREVERSIBLE DE L'ELASTASE PANCREATIQUE DE PORC PAR DES COMPOSES FLUORES by INES MARGARITA LI DE LA SIERRA(
Book
)
2 editions published in 1992 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
NOUS DECRIVONS DANS CETTE THESE L'ANALYSE TRIDIMENSIONNELLE PAR DIFFRACTION X DE LA STRUCTURE DE LA PPE (EC3.4.21.11) AVEC DEUX INHIBITEURS, L'UN PEPTIDIQUE TRIFLUOROACETYLE (TFLA: TRIFLUOROACETYL-LEUCYL-ALANYL-PARATRIFLUORO-ANILIDE), L'AUTRE UN -LACTAME DU TYPE N-ARYL AZETIDINONE FONCTIONNALISEE (AA231-1:N-(2-CHLOROMETHYLPHENYL) 2,2-DIFLUOROAZETIDIN-2-ONE), DEPUIS LA PREPARATION DES CRISTAUX JUSQU'A L'AFFINEMENT DU MODELE ATOMIQUE. LA PREMIERE MOLECULE (TFLA) EST UN INHIBITEUR REVERSIBLE DE LA PPE (K#M EGAL A 2,510##8 M). L'AUTRE (AA231-1) EST UN INHIBITEUR IRREVERSIBLE DE TYPE SUICIDE (K#I#N#A#C#T/K#1 EGAL A 296 M##1 S##1). LES CRISTAUX DES COMPLEXES ONT ETE OBTENUS PAR CO-CRISTALLISATION AVEC L'ENZYME DANS UNE SOLUTION D'ACETATE DE SODIUM/DIMETHYLFORMAMIDE. NOUS AVONS AUSSI CRISTALLISE LA PPE NATIVE DANS LES MEMES CONDITIONS, DANS LE PREMIER CAS A PH=5,5 EN PRESENCE DE SULFATE DE SODIUM COMME AGENT PRECIPITANT, DANS LE DEUXIEME CAS, DANS L'ACETATE DE SODIUM NON TAMPONNEE ET SANS AGENT PRECIPITANT. LA FIXATION DES INHIBITEURS NE MODIFIE PAS LE GROUPE D'ESPACE DE LA PPE NATIVE (ORTHORHOMBIQUE P2#12#12#1). LES PARAMETRES DE LA MAILLE SONT POUR LE COMPLEXE PPE/TFLA: A=75,26 A, B=57,47 A ET C=52,53 A, POUR LE COMPLEXE PPE/AA231-1: A=75,7 A B=58,2 ET C=52,1 A. LES INHIBITEURS ONT ETE LOCALISES SUR LES CARTES DE FOURIER DIFFERENCE DANS LE SITE ACTIF DE L'ENZYME ET L'AFFINEMENT DE LEURS STRUCTURES A ETE REALISE PAR RECUIT SIMULEE (XPLOR). LES MODELES DE LA PPE NATIVE ET DU COMPLEXE PPE/TFLA ONT ETE AFFINES CONTRE LES DONNEES DE L'ELASTASE NATIVE A 2,5 A DE RESOLUTION (REF. 2EST, PDB) ET LEURS STRUCTURES ONT ETE OBTENUES A 1,8 A DE RESOLUTION (REF. 6EST ET 7EST, PDB). LE COMPLEXE PPE/AA231-1 A ETE AFFINE CONTRE LES DONNEES DE L'ELASTASE NATIVE A 1,8 A DE RESOLUTION ET SA STRUCTURE A ETE COMPLETEE A 1,7 A DE RESOLUTION. LA MOLECULE DE TFLA EST FIXEE AUTOUR DU RESIDU PHE-215, DANS UNE CONFORMATION DE FEUILLET- PARALLELE, CONTRAIREMENT A CELLE QUE L'ON OBSERVE POUR LES INHIBITEURS ANALOGUES DE SUBSTRATS ET LES GRANDES MOLECULES DE SUBSTRATS NATURELS. LE -LACTAME AA231-1 EST FIXE DE FACON COVALENTE AU RESIDU CATALYTIQUE HIS-57. LA LIAISON ESTER AVEC LE RESIDU ACTIF SER-195 N'EST PAS OBSERVEE. UN NOUVEAU MODE DE FIXATION A ETE MIS EN EVIDENCE POUR CET INHIBITEUR IRREVERSIBLE ET UN MECANISME DE FIXATION EST PROPOSE POUR RENDRE COMPTE DES OBSERVATIONS EXPERIMENTALES. CETTE ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE A PERMIS DE REMARQUER LE ROLE CLE DE QUELQUES RESIDUS LOCALISES DANS LE SITE ACTIF DE L'ENZYME, EN PARTICULIER LES RESIDUS SER-214, PHE-215, GLN-192 ET VAL-99, QUI NE SONT PAS IMPLIQUES DIRECTEMENT DANS LE MECANISME CATALYTIQUE, MAIS DONT LE ROLE DANS LA RECONNAISSANCE SEMBLE CAPITAL
2 editions published in 1992 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
NOUS DECRIVONS DANS CETTE THESE L'ANALYSE TRIDIMENSIONNELLE PAR DIFFRACTION X DE LA STRUCTURE DE LA PPE (EC3.4.21.11) AVEC DEUX INHIBITEURS, L'UN PEPTIDIQUE TRIFLUOROACETYLE (TFLA: TRIFLUOROACETYL-LEUCYL-ALANYL-PARATRIFLUORO-ANILIDE), L'AUTRE UN -LACTAME DU TYPE N-ARYL AZETIDINONE FONCTIONNALISEE (AA231-1:N-(2-CHLOROMETHYLPHENYL) 2,2-DIFLUOROAZETIDIN-2-ONE), DEPUIS LA PREPARATION DES CRISTAUX JUSQU'A L'AFFINEMENT DU MODELE ATOMIQUE. LA PREMIERE MOLECULE (TFLA) EST UN INHIBITEUR REVERSIBLE DE LA PPE (K#M EGAL A 2,510##8 M). L'AUTRE (AA231-1) EST UN INHIBITEUR IRREVERSIBLE DE TYPE SUICIDE (K#I#N#A#C#T/K#1 EGAL A 296 M##1 S##1). LES CRISTAUX DES COMPLEXES ONT ETE OBTENUS PAR CO-CRISTALLISATION AVEC L'ENZYME DANS UNE SOLUTION D'ACETATE DE SODIUM/DIMETHYLFORMAMIDE. NOUS AVONS AUSSI CRISTALLISE LA PPE NATIVE DANS LES MEMES CONDITIONS, DANS LE PREMIER CAS A PH=5,5 EN PRESENCE DE SULFATE DE SODIUM COMME AGENT PRECIPITANT, DANS LE DEUXIEME CAS, DANS L'ACETATE DE SODIUM NON TAMPONNEE ET SANS AGENT PRECIPITANT. LA FIXATION DES INHIBITEURS NE MODIFIE PAS LE GROUPE D'ESPACE DE LA PPE NATIVE (ORTHORHOMBIQUE P2#12#12#1). LES PARAMETRES DE LA MAILLE SONT POUR LE COMPLEXE PPE/TFLA: A=75,26 A, B=57,47 A ET C=52,53 A, POUR LE COMPLEXE PPE/AA231-1: A=75,7 A B=58,2 ET C=52,1 A. LES INHIBITEURS ONT ETE LOCALISES SUR LES CARTES DE FOURIER DIFFERENCE DANS LE SITE ACTIF DE L'ENZYME ET L'AFFINEMENT DE LEURS STRUCTURES A ETE REALISE PAR RECUIT SIMULEE (XPLOR). LES MODELES DE LA PPE NATIVE ET DU COMPLEXE PPE/TFLA ONT ETE AFFINES CONTRE LES DONNEES DE L'ELASTASE NATIVE A 2,5 A DE RESOLUTION (REF. 2EST, PDB) ET LEURS STRUCTURES ONT ETE OBTENUES A 1,8 A DE RESOLUTION (REF. 6EST ET 7EST, PDB). LE COMPLEXE PPE/AA231-1 A ETE AFFINE CONTRE LES DONNEES DE L'ELASTASE NATIVE A 1,8 A DE RESOLUTION ET SA STRUCTURE A ETE COMPLETEE A 1,7 A DE RESOLUTION. LA MOLECULE DE TFLA EST FIXEE AUTOUR DU RESIDU PHE-215, DANS UNE CONFORMATION DE FEUILLET- PARALLELE, CONTRAIREMENT A CELLE QUE L'ON OBSERVE POUR LES INHIBITEURS ANALOGUES DE SUBSTRATS ET LES GRANDES MOLECULES DE SUBSTRATS NATURELS. LE -LACTAME AA231-1 EST FIXE DE FACON COVALENTE AU RESIDU CATALYTIQUE HIS-57. LA LIAISON ESTER AVEC LE RESIDU ACTIF SER-195 N'EST PAS OBSERVEE. UN NOUVEAU MODE DE FIXATION A ETE MIS EN EVIDENCE POUR CET INHIBITEUR IRREVERSIBLE ET UN MECANISME DE FIXATION EST PROPOSE POUR RENDRE COMPTE DES OBSERVATIONS EXPERIMENTALES. CETTE ETUDE CRISTALLOGRAPHIQUE A PERMIS DE REMARQUER LE ROLE CLE DE QUELQUES RESIDUS LOCALISES DANS LE SITE ACTIF DE L'ENZYME, EN PARTICULIER LES RESIDUS SER-214, PHE-215, GLN-192 ET VAL-99, QUI NE SONT PAS IMPLIQUES DIRECTEMENT DANS LE MECANISME CATALYTIQUE, MAIS DONT LE ROLE DANS LA RECONNAISSANCE SEMBLE CAPITAL
ETUDE STRUCTURALE D'UNE PROTEINE DE LA MEMBRANE EXTERNE DE LA BACTERIE NEISSERIA MENINGITIDIS by LUCILE PERNOT(
Book
)
2 editions published in 1999 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
LA PROTEINE DE LA MEMBRANE EXTERNE, P64K (64 KDA), DU MENINGOCOQUE NEISSERIA MENINGITIDIS EST UNE DES PROTEINES VACCINANTES POTENTIELLES, ENVISAGEES DANS LA PREPARATION D'UN VACCIN ANTI-MENINGITE CONTRE LE SEROGROUPE B. CETTE PROTEINE (599 RESIDUS) APPARTIENT A LA FAMILLE DES FLAVOPROTEINES : ELLE POSSEDE UN DOMAINE DIHYDROLIPOAMIDE DESHYDROGENASE (DLDH, 482 RESIDUS) RELIE PAR UN SEGMENT FLEXIBLE (81 RESIDUS) A UN DOMAINE LIPOIQUE (86 RESIDUS) DU COTE DE SON EXTREMITE N-TERMINALE. LA P64K EST L'UNE DES PREMIERES DLDH CARACTERISEE AVEC UN DOMAINE LIPOIQUE. LA CONNAISSANCE DE SA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE, PAR LA DIFFRACTION DES RAYONS X, DOIT PERMETTRE DE LOCALISER LES REGIONS IMPLIQUEES DANS LA REPONSE IMMUNITAIRE. LES METHODES DU REMPLACEMENT MOLECULAIRE ET DU REMPLACEMENT ISOMORPHE ONT ETE EMPLOYEES PARALLELEMENT POUR PARVENIR A LA RESOLUTION DE LA STRUCTURE. UN PREMIER MODELE PARTIEL DU DOMAINE DLDH A ETE DETERMINE PAR REMPLACEMENT MOLECULAIRE. LE PROBLEME DES PHASES A ETE RESOLU PAR LA METHODE DU REMPLACEMENT ISOMORPHE EN UTILISANT LE TAMM (COMPOSE A 4 ATOMES DE MERCURE) A 0,6 MM ET LE XENON A L'ETAT GAZEUX (13 BAR) POUR OBTENIR DES DERIVES LOURDS. CES DONNEES ONT VALIDE LE PREMIER MODELE DU DOMAINE DLDH OBTENU REMPLACEMENT MOLECULAIRE, PUIS ONT PERMIS DE L'AMELIORER ET D'ACHEVER SA CONSTRUCTION. CE MODELE A ETE AFFINE A 2,7 A DE RESOLUTION. LES DONNEES DE DIFFRACTION ENREGISTREES SUR UN CRISTAL CONGELE A UNE TEMPERATURE DE 140\C ONT PERMIS D'AFFINER LE MODELE DU DOMAINE DLDH A 2,23 A DE RESOLUTION. LE DOMAINE DLDH ADOPTE UN REPLIEMENT SIMILAIRE A CELUI DES DLDH DE STRUCTURES CONNUES. LE CENTRE CATALYTIQUE, SITUE A L'INTERFACE DE L'HOMODIMERE, EST FORME PAR LE FAD, UN PONT DISULFURE INTRAHELICAL (CYS161-CYS166) ET UN RESIDU HISTIDINE (HIS572*). LA STRUCTURE DU DOMAINE DLDH EN PRESENCE DU NAD + A ETE DETERMINE A UNE RESOLUTION DE 2,6 A. LE DETERMINANT ANTIGENIQUE MAJEUR DU DOMAINE DLDH A ETE LOCALISE DANS CE MODELE. IL EST SITUE A LA SURFACE DE LA PROTEINE ET EST CONSTITUE D'UNE BOUCLE DE 10 RESIDUS FLANQUEE DE DEUX BRINS . UN COMPLEXE DE TYPE ANTIGENE-ANTICORPS ENTRE LE FRAGMENT FAB D'UN ANTICORPS MONOCLONAL ET LE DOMAINE LIPOIQUE A ETE PREPARE POUR ETENDRE L'ETUDE STRUCTURALE AU DOMAINE LIPOIQUE DE LA P64K. LES PREMIERS ESSAIS DE CRISTALLISATION DE CE COMPLEXE ANTIGENE-ANTICORPS ONT ETE DEBUTES
2 editions published in 1999 in French and held by 3 WorldCat member libraries worldwide
LA PROTEINE DE LA MEMBRANE EXTERNE, P64K (64 KDA), DU MENINGOCOQUE NEISSERIA MENINGITIDIS EST UNE DES PROTEINES VACCINANTES POTENTIELLES, ENVISAGEES DANS LA PREPARATION D'UN VACCIN ANTI-MENINGITE CONTRE LE SEROGROUPE B. CETTE PROTEINE (599 RESIDUS) APPARTIENT A LA FAMILLE DES FLAVOPROTEINES : ELLE POSSEDE UN DOMAINE DIHYDROLIPOAMIDE DESHYDROGENASE (DLDH, 482 RESIDUS) RELIE PAR UN SEGMENT FLEXIBLE (81 RESIDUS) A UN DOMAINE LIPOIQUE (86 RESIDUS) DU COTE DE SON EXTREMITE N-TERMINALE. LA P64K EST L'UNE DES PREMIERES DLDH CARACTERISEE AVEC UN DOMAINE LIPOIQUE. LA CONNAISSANCE DE SA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE, PAR LA DIFFRACTION DES RAYONS X, DOIT PERMETTRE DE LOCALISER LES REGIONS IMPLIQUEES DANS LA REPONSE IMMUNITAIRE. LES METHODES DU REMPLACEMENT MOLECULAIRE ET DU REMPLACEMENT ISOMORPHE ONT ETE EMPLOYEES PARALLELEMENT POUR PARVENIR A LA RESOLUTION DE LA STRUCTURE. UN PREMIER MODELE PARTIEL DU DOMAINE DLDH A ETE DETERMINE PAR REMPLACEMENT MOLECULAIRE. LE PROBLEME DES PHASES A ETE RESOLU PAR LA METHODE DU REMPLACEMENT ISOMORPHE EN UTILISANT LE TAMM (COMPOSE A 4 ATOMES DE MERCURE) A 0,6 MM ET LE XENON A L'ETAT GAZEUX (13 BAR) POUR OBTENIR DES DERIVES LOURDS. CES DONNEES ONT VALIDE LE PREMIER MODELE DU DOMAINE DLDH OBTENU REMPLACEMENT MOLECULAIRE, PUIS ONT PERMIS DE L'AMELIORER ET D'ACHEVER SA CONSTRUCTION. CE MODELE A ETE AFFINE A 2,7 A DE RESOLUTION. LES DONNEES DE DIFFRACTION ENREGISTREES SUR UN CRISTAL CONGELE A UNE TEMPERATURE DE 140\C ONT PERMIS D'AFFINER LE MODELE DU DOMAINE DLDH A 2,23 A DE RESOLUTION. LE DOMAINE DLDH ADOPTE UN REPLIEMENT SIMILAIRE A CELUI DES DLDH DE STRUCTURES CONNUES. LE CENTRE CATALYTIQUE, SITUE A L'INTERFACE DE L'HOMODIMERE, EST FORME PAR LE FAD, UN PONT DISULFURE INTRAHELICAL (CYS161-CYS166) ET UN RESIDU HISTIDINE (HIS572*). LA STRUCTURE DU DOMAINE DLDH EN PRESENCE DU NAD + A ETE DETERMINE A UNE RESOLUTION DE 2,6 A. LE DETERMINANT ANTIGENIQUE MAJEUR DU DOMAINE DLDH A ETE LOCALISE DANS CE MODELE. IL EST SITUE A LA SURFACE DE LA PROTEINE ET EST CONSTITUE D'UNE BOUCLE DE 10 RESIDUS FLANQUEE DE DEUX BRINS . UN COMPLEXE DE TYPE ANTIGENE-ANTICORPS ENTRE LE FRAGMENT FAB D'UN ANTICORPS MONOCLONAL ET LE DOMAINE LIPOIQUE A ETE PREPARE POUR ETENDRE L'ETUDE STRUCTURALE AU DOMAINE LIPOIQUE DE LA P64K. LES PREMIERS ESSAIS DE CRISTALLISATION DE CE COMPLEXE ANTIGENE-ANTICORPS ONT ETE DEBUTES
Synthesis and Conformational Analysis of Fluorinated Pipecolic Acids(
)
1 edition published in 2012 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2012 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Structural analysis of urate oxidase in complex with its natural substrate inhibited by cyanide: Mechanistic implications by
Laure Gabison(
)
1 edition published in 2008 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
1 edition published in 2008 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Etude du mécanisme de l'urate oxydase par diffraction des rayons X et spectroscopie RPE by
Laure Gabison(
Book
)
2 editions published in 2009 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide
Urate oxidase is a key enzyme of the purine degradation pathway. This protein work without cofactor (metallic nor organic) and catalyse in presence of molecular oxygen, the degradation of urate (uric acid mono-anion) into 5-hydroxyisourate with release of hydrogen peroxide. 5-hydroxyisourate finally decomposes spontaneously or via two specific proteins to allantoïne. Urate oxidase mechanism is studied since the beginning of the century and it still remains nottotally understood. X-Ray diffraction and EPR spectroscopy allow bringing new lighting on urate oxidas mechanism. EPR spectroscopy shows the radical character of the mechanism and brings to propose the electronic state of some intermediate. Tridimensional studies by x-ray diffraction of high resolution inhibitor-enzyme complexes suggest urate déprotonation for the first step of the mechanism to give di-deprotonated intermediate on N3 and N7 atoms of uric acid. Several approach to block the natural substrate in the active site confirm deprotonated state and also permit to propose dehydrourate as stable relational intermediate. Finally different fruitless attempts to detect the hypothetic 5-hydroperoxyisourate intermediate from literature drove to formulate hypothesis of a direct passage to dehydrourate or generation of 4-hydroperoxyisourate. Dehydrourate is the hydroxyled and un-complexe from the active site. From all the result two news alternative mechanism were suggested
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Urate oxidase is a key enzyme of the purine degradation pathway. This protein work without cofactor (metallic nor organic) and catalyse in presence of molecular oxygen, the degradation of urate (uric acid mono-anion) into 5-hydroxyisourate with release of hydrogen peroxide. 5-hydroxyisourate finally decomposes spontaneously or via two specific proteins to allantoïne. Urate oxidase mechanism is studied since the beginning of the century and it still remains nottotally understood. X-Ray diffraction and EPR spectroscopy allow bringing new lighting on urate oxidas mechanism. EPR spectroscopy shows the radical character of the mechanism and brings to propose the electronic state of some intermediate. Tridimensional studies by x-ray diffraction of high resolution inhibitor-enzyme complexes suggest urate déprotonation for the first step of the mechanism to give di-deprotonated intermediate on N3 and N7 atoms of uric acid. Several approach to block the natural substrate in the active site confirm deprotonated state and also permit to propose dehydrourate as stable relational intermediate. Finally different fruitless attempts to detect the hypothetic 5-hydroperoxyisourate intermediate from literature drove to formulate hypothesis of a direct passage to dehydrourate or generation of 4-hydroperoxyisourate. Dehydrourate is the hydroxyled and un-complexe from the active site. From all the result two news alternative mechanism were suggested
Réaction de Dieckman appliquée aux ester-nitriles synthèse d'énols stables by
Thierry Prangé(
Book
)
1 edition published in 1969 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide
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