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École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire)

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Works: 427 works in 427 publications in 1 language and 428 library holdings
Roles: Other, 996
Publication Timeline
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Most widely held works by Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire) École doctorale Santé
Contrôle génétique et physiologique de la prolificité en race ovine lacaune : caractérisation de la mutation causale et role fonctionnel du gene FECL by Camille Mansanet( )

1 edition published in 2013 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

The aim of this thesis was to identify a mutation called FecLL affecting ovulation rate and prolificacy of Lacaune sheep and to study its physiological consequences. By combining genetics and functional highthroughput biology approaches such as Roche 454 sequencing and mass spectrometry, I evidenced the FecLL mutation as a 2 SNP haplotype present in non-coding regions of a 194.6 kb locus on ovine chromosome 11. This mutation induces ectopic overexpression and ovarian activity of the B4GALNT2 (beta-1,4-N-acetylgalactosaminyl transferase 2) gene encoding a glycosylation enzyme capable of transferring a N-acetylgalactosamine sugar on target glycoproteins. Among those targets, I highlighted inhibin A, an important hormone in ovarian function. The consequences of this atypical glycosylation lead to impaired production of inhibin A in Lacaune mutated sheep proposed as an initiator mechanism of their hyper- prolificacy
Modélisation du dichroïsme circulaire des protéines : modèle simple et applications by Viet-Dung Tran( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

La spectroscopie de dichroïsme circulaire (CD) est une des techniques fondamentales en biologie structurale qui permet la détermination du contenu en structures secondaires d'une protéine. Le rayonnement synchrotron a considérablement augmenté l'utilité de la méthode, car il permet de travailler avec une gamme spectrale étendue et à meilleure intensité. Le développement de modèles permettant d'établir une relation entre la structure d'une protéine et son spectre CD d'une manière efficace n'a pourtant pas suivi l'évolution technique et l'analyse de spectres CD de protéines entières reste un défi sur le plan théorique. Dans ce contexte, nous avons développé un modèle "minimaliste" pour la spectroscopie CD des protéines, où chaque atome C-alpha de la chaîne principale porte un oscillateur de Lorentz classique, i.e. une charge mobile qui est tenue par un potentiel quadratique. Les oscillateurs sont couplés par un potentiel coulombien et leurs déplacements suivent les tangentes locales respectives de la courbe spatiale décrite par les atomes C-alpha. Le système d'oscillateurs est couplé à une onde électromagnétique plane décrivant la source de lumière et le phénomène d'absorption est modélisé par des forces de friction. Nous montrons que le modèle reproduit correctement le phénomène CD d'une chaîne polypeptidique hélicoïdale et en particulier son signe en fonction de l'orientation de la chaîne. Comme première application, nous présentons l'ajustement du modèle au spectre CD d'un polypeptide composé de 15 résidus qui se plie sous forme d'une hélice alpha. La transférabilité de ces paramètres est ensuite évaluée pour la myoglobine, une protéine de 153 résidus contenant 8 hélices alpha
Synthèse de nouveaux dérivés pyridopyrimidiniques, imidazopyridiniques et imidazopyridaziniques : évaluation de leurs propriétés biologiques. by Oussama Dehbi( )

1 edition published in 2012 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Products belonging to the pyridopyrimidine family are characterized by their intense use in pharmacology. The increase of interest for this heterocyclic scaffold prompted different research teams around the world to study their chemically and biologically properties. In this work, we are interested in the functionalization of pyridopyrimidines and, more specifically, of the less described regioisomer, namely pyrido[3,2-d]pyrimidines. The target compounds were synthesized from 2,7-dichloropyrido[3,2-d]pyrimidine via nucleophilic aromatic substitution and palladium-catalyzed couplings and, in order to obtain potent kinases inhibitors. Our goal has been achieved with several elaborate molecules. These bioactive compounds inhibit kinases such as Cyclin Dependant Kinases (CDK), Glycogen Synthase 3 (GSK3) or Dual specificity tYRosine-phosphorylation-regulated Kinase 1A (DYRK1A) in the nanomolar range. These biological targets are mainly involved in degenerative process or down syndrome. These pharmacological results led us to extend our studies to other pyridopyrimidines, namely pyrido[2,3-d]pyrimidines as well as other types of polynitrogenated bicycles, namely imidazo[1,2- a]pyridine and imidazo[1,2-b]pyridazine
Caractérisation des aminopeptidases N du parasite Eimeria tenella et implication en tant que cibles thérapeutiques de nouvelle génération pour lutter contre les coccidioses aviaires by Simon Gras( )

1 edition published in 2013 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Eimeria tenella est l'un des parasites apicomplexes à l'origine de la coccidiose aviaire, l'une des plus importantes maladies parasitaires de l'industrie avicole. Dans le but de caractériser les facteurs de pathogénicité d'E. tenella, nous nous sommes intéressés aux protéases et plus particulièrement aux aminopeptidases N. Nous avons caractérisé Et-ApN1 et identifié Et-ApN3, deux aminopeptidases d'E. tenella. Et-ApN1 présente de fortes homologies avec PfA-M1, l'homologue de Plasmodium falciparum, au niveau des séquences, des structures, des propriétés biochimiques, du clivage et de la localisation. L'ensemble des résultats suggèrent qu'Et-ApN1 est impliquée dans le développement parasitaire. Pour évaluer son rôle de cible thérapeutique potentielle, nous avons criblé une bibliothèque de molécules et identifié une nouvelle molécule le C36, qui inhibe directement l'activité d'Et-ApN1 et entraîne un arrêt du développement d'E. tenella in vitro. Cet effet inhibiteur est également observé chez Toxoplasma gondii et P. falciparum. Dans le but d'améliorer la solubilité du C36 pour de futures études in vivo, le C36 a été pharmaco-modulé. Les perspectives de ces travaux viseront à prouver l'implication directe des Et-ApN dans le développement d'E. tenella
La formation d'éducateurs socio-sportifs en "licence professionnelle développement social et médiation par le sport" : étude de la dynamique des expériences vécues dans un dispositif multimodal by Karine Paret( )

1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

The social sport educator (SSE) gets deeply involved in environments imbued with social tensions. This professional in social sport intervention faces the reality of the job and owns skills to persevere in his function and ensure his professional sustainability. In the professional degree in Orleans, a multimodal system is drawn from the findings of the research in order to develop skills: it is the area of study. Various training situations take place : workshops consisting in exchanging about practical experiences among peers, intervention workshops with targeted audiences (the latter relates to child welfare and judicial protection of juveniles), workshops whose aim is to shareexperiences, which enables the SSE to exchange about important moments with a class student for the benefit oftheir professional development, workshops consisting in the assessment of vocational training.This study is carried out within the theoretical framework of course-of-action in cognitive anthropology(Theureau, 1992, 2004) and follows the Grounded Theory (Glaser & Strauss, 2017). It is also complementary and it takes on the SSE's point of view to analyze key moments as well as the dynamics of their professional development
Biodiversité et évolution des virus présents dans les métagénomes animaux by Diane Bigot( )

1 edition published in 2017 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Viruses are among the most abundant entities on Earth, but the viral diversity remains mostly unknown as currently biased in favour of animals of social, agronomic and economic interest. Next Generation Sequencing technologies provide access to so far inaccessible information. The aim of my PhD thesis was the study of the viral diversity within a large range of non-model animals. To address this question I set up an innovative analytical framework to discover new viruses based on a meta-transcriptomic approach. This work i) shows that this bioinformatics method is efficient and powerful, ii) allows the discovery of new viruses with particular genomic organisations suggesting they belong to new virus genera of families, iii) uncovered new viruses from new hosts in well-known viral families and iv) shows wider viral host range than previously expected based on a particular focus on hymenopteran viral diversity. Overall, my work allows to fill some gaps in the knowledge of viral diversity and shows the importance of studying non-model animal species in virology
Analyse de molécules d'intérêt biologique en chromatographie supercritique et chromatographie unifiée - Etudes fondamentales et applications by Adrien Raimbault( )

1 edition published in 2019 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

SFC is an old analytical technique that took time to establish itself in the morals of chromatographers, remaining for many years in the shadow of HPLC and GC. Small and non-polar molecules are easily analysed using this technique because of the low polarity of carbon dioxide. What about polar compounds? Several methods can be used to analyse them. An intermediate technique between SFC and HPLC was used, unified chromatography.This research deals with methods for analysing molecules of higher polarity, such as amino acids. Stationary phases were studied using the LSER model to understand the behaviour of such molecules in a supercritical environment. A method development was performed for amino acid analysis. This method was then used for various applications (food supplements, plant of pharmaceutical interest)
Signature moléculaire de milieux complexes : Stratégie de couplage à la spectrométrie de masse et interprétation des données by Laëtitia Fougère( )

1 edition published in 2019 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

The metabolite composition of living organisms changes when they are subjected to environmental modification and differs from one species to another. The aim of this PhD thesis was to deploy different chromatographic coupling strategies with mass spectrometry and MS data processing in order to respond in the most relevant way to the various problems encountered in terms of characterization, quantification and comparison of the molecular content of complex samples.Firstly, these studies led to the development of TLC/MS dereplication methods to rapidly identify known molecules and to evaluate the composition of samples. In order to improve and standardize the comparison of different samples, image processing of TLC plates were performed and statistical studies were applied. In addition, the hyphenation TLC/MS have been developed to identify different low molecular mass families (flavonoids, steroids). In a second way, a methodology was implemented in UHPLC/HRMS to characterize the presence of C and O-glycosyl flavonoids in corn silk samples of five different varieties and help in the varietal selection to fight against pest infestation. Visual representation approaches of molecular content were used to target the molecules of interest which were they were quantified by UHPLC/MRM MS. The different chromatographic fingerprints were then compared using statistical treatments in order to highlight the differences between these five varieties and thus to identify the molecules allowing this distinction
Etudes des effets neurodéveloppementaux induits par l'exposition périnatale à un pesticide, le glufosinate d'ammonium : de la neurogenèse au comportement by Ameziane Herzine( )

1 edition published in 2016 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Le glufosinate d'ammonium (GLA) est un herbicide largement utilisé dans l'agriculture. Comme cela est le cas pour la plupart des pesticides, ses effets neurotoxiques et développementaux n'ont été que partiellement étudiés. L'exposition précoce des pesticides peut affaiblir la structure de base du développement du cerveau et provoquer des changements permanents conduisant un large éventail d'effets à long terme sur la santé et/ou sur le comportement. Mes travaux de thèse ont permis de montrer que l'exposition périnatale à de faibles doses de GLA induisait des perturbations de la neurogenèse et de la migration des neuroblastes au niveau de la zone sous ventriculaire vers les bulbes olfactifs. De plus l'analyse transcriptomique cérébrale montre une modification significative de l'expression de nombreux gènes responsables de la dynamique du cytosquelette impliqué dans la régulation de la migration des neuroblastes. Etant un analogue structural du glutamate, le GLA pourrait agir sur le cytosquelette via la modification de la polyglutamylation de la tubuline. Cette hypothèse expliquerait les altérations cellulaires observées. Par ailleurs, avons mis en évidence dans cette étude, des troubles du comportement des souris exposées semblables à ceux observables chez les modèles murins des « troubles du spectre autistique » (ASD-like)
Etude électrophysiologique des réponses auditives corticales chez l'enfant avec une réhabilitation auditive by David Bakhos( )

1 edition published in 2012 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les enfants sourds congénitaux ne peuvent pas acquérir le langage oral. L'acquisition du langage après réhabilitation montre des différences individuelles qui peuvent être liées à la réorganisation corticale consécutive à la surdité. Le fonctionnement auditif cortical peut être exploré par les méthodes électrophysiologiques. Notre première étude a permis de montrer une relation entre les réponses auditives temporales (onde N1c) et les capacités langagières chez des enfants avec une réhabilitation audioprothétique. Dans une seconde étude, nous avons mis en évidence une réponse spécifique à la voix humaine chez les enfants implantés cochléaires ayant un bon niveau de langage. La distribution de cette réponse est cependant différente de celle obtenue chez les enfants normo-entendants. La réduction de l'artefact dû à l'implant cochléaire a été une étape préliminaire indispensable à l'analyse des potentiels évoqués auditifs corticaux. L'identification de tels marqueurs permettra de définir des facteurs pronostics et de mieux repérer les enfants nécessitant une adaptation précoce de la rééducation
Productivité des forêts mélangées : effet de la diversité en essences dans un contexte climatique et édaphique variable by Maude Toïgo( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les changements environnementaux à l'échelle globale peuvent se traduire par une modification des conditions abiotiques et de la diversité biologique. La fonction de production des écosystèmes forestiers a la particularité d'être à la fois soumise à, et régulatrice de ces changements environnementaux. Il apparaît alors primordial de comprendre la manière dont la diversité en essences et les facteurs abiotiques exercent le contrôle de cette fonction. Au cours de mes travaux j'ai étudié la variation de l'effet du mélange d'essences sur leur productivité dans un contexte climatique et édaphique changeant. Grâce à une double approche, basée sur des données locales et des données de l'Inventaire forestier national, je me suis concentrée sur cinq espèces forestières européennes majeures en peuplements purs et bispécifiques : Quercus petraea, Pinus sylvestris, Fagus sylvatica, Abies alba et Picea abies. En plaine je montre que l'effet du mélange d'essences varie peu avec les facteurs abiotiques. De plus cet effet est déterminé par la tolérance à l'ombrage de l'espèce accompagnatrice. En montagne l'effet du mélange d'essences sur leur productivité est plus fort et positif lorsque les facteurs abiotiques sont les plus limitants pour la croissance. Ces résultats illustrent l'intérêt d'intégrer les facteurs abiotiques et les caractéristiques fonctionnelles des espèces comme déterminants de l'effet de la diversité biologique sur les fonctions de l'écosystème
Synthèse et pharmacomodulations de composés naturels issus de plantes by Geoffrey Dumonteil( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Polyene units constitute an important function from organic compounds and are present in many natural products in the form of 1,3-conjugated dienes. It is therefore essential to develop methods to access these dienes while wearing a careful look at the environmental impact. During this work, we were able to synthesize a natural compound which has activity on type II diabetes: the abscisic acid. The key step leading to the success of this synthesis is the Heck reaction. From these results, we have developed a robust and efficient method to obtain various diene compounds (E, Z) and trienes (E, E, Z) without ligand or solvent. The compounds thus obtained are considered as potential analogues of the abscisic acid and are involved in various reactions in order to obtain the corresponding carboxylic acid or its bioisostere. In parallel with this synthesis application, we have developed a pathway to obtain benzo[d]thiazole compounds substituted in position 2 with an N-aryl or N-alkyl. This synthetic methodology is part of a context of environmental compatibility by using iodine catalyst
Impact d'un sevrage à l'alcool sur l'activité du réseau hippocampo-préfrontal au cours d'une épreuve de mémoire de travail : comparaison avec le stress chronique léger imprédictible by Gaëlle Dominguez( )

1 edition published in 2014 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Our study was aimed to determine the involvement of central corticosterone on the activity of hippocampalprefrontal cortex (HPC-PFC) network and its role in the emergence of working memory (WM) alterations during chronic alcohol consumption (12% for 6 months), or after a short (1 week) or a prolonged (6 weeks) withdrawal periods. The alcohol-withdrawal effects were compared to those resulting from an unpredictable mild chronic stress (UCMS), modeling depression. Our data showed that withdrawal and UCMS, but not alcohol, induced WM disorders and deficits of CREB activation in both the PFC and HPC, and an excessive corticosterone increase specifically in the PFC of withdrawn animals. Pharmacological experiments showed that the inhibition of corticosterone synthesis restored pCREB activity in the PFC of both withdrawn and UCMS mice and improved WM. Furthermore, in withdrawn mice, the increase of pCREB or the blockade of the mineralo-corticoid receptor in the PFC, but not in the HPC, restored WM performance. These results demonstrated that corticosterone dysfunction into the PFC plays a key role in the long-lasting cognitive and neural activity disorders of alcohol-withdrawn mice. We also showed that chronic administration of diazepam reduced such alterations only transitorily. Thus, overall, our study suggests that compounds acting on the GCs activity may constitute alternative strategies to prevent the emergence and maintenance of cognitive disorders induced by alcohol withdrawal
Caractérisation de l'opéron métabolique fru2 de Streptococcus agalactiae : phylogénie, induction, et régulation by Kévin Patron( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Streptococcus agalactiae est la première cause d'infections néonatales, et est aussi un pathogène émergent chez l'adulte immunodéprimé. L'objectif de ce travail de thèse a été de caractériser l'opéron métabolique fru2 de S. agalactiae (i) en étudiant sa phylogénie, (ii) en identifiant ses inducteurs, et (iii) en élaborant son schéma de régulation. Cet opéron est composé de 7 gènes qui codent un activateur transcriptionnel de la famille DeoR-like (Fru2R), un transporteur PTS (PTSFru2), et trois enzymes qui sont potentiellement impliquées dans la voie non oxydative des pentoses phosphates. Nous avons mis en évidence que cet opéron avait été acquis au cours de l'évolution, et n'était présent que chez les souches de complexes clonaux responsables d'infections chez l'adulte immunodéprimé et la personne âgée. Nous avons ensuite montré que certains milieux complexes, sources de carbone, et liquides biologiques humains permettaient l'activation de cet opéron. Ensuite, nous avons caractérisé le rôle et fonctionnement de la protéine Fru2R (i) en montrant son rôle d'activateur transcriptionnel, (ii) en identifiant les acides aminés essentiels à son activité, et (iii) en démontrant sa capacité à se fixer au niveau de la région promotrice de fru2
Stress thermique et thermorégulation chez lez insectes hématophages by Chloé Lahondère( )

1 edition published in 2012 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Les insectes sont soumis aux fluctuations thermiques de leur environnement mais disposent d'un panel varié de réponses comportementales, physiologiques et biochimiques pour en minimiser les effets délétères et maintenir leur intégrité physiologique. Ainsi certaines espèces régulent activement leur température interne indépendamment de la température de l'environnement. Si ces insectes peuvent s'affranchir des contraintes thermiques imposées par leur environnement, ceux qui se nourrissent du sang chaud d'hôtes vertébrés endothermes n'ont pas d'autres choix que de se confronter à une situation de stress thermique à chaque prise alimentaire. Le principal objectif de ce travail de thèse est de comprendre comment des insectes hématophages, employant des stratégies alimentaires différentes, gèrent le stress thermique associé au flux massif de chaleur engendré par l'ingestion du repas de sang. Nos résultats montrent que ces insectes ont su s'adapter en développant différentes stratégies de thermorégulation
Du jeu des sélections chez une pyrale musicienne : étude de l'origine, de l'évolution et du maintien sélectif des comportements sexuels by Sylvain Alem( )

1 edition published in 2012 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Pour comprendre comment la sélection naturelle modèle les traits sexuels, l'emploi d'une approche intégrative des processus sélectifs en jeu semble aujourd'hui indispensable. Durant ma thèse je me suis ainsi intéressé aux influences simultanées des sélections de viabilité et sexuelle sur l'origine, l'évolution et le maintien des traits sexuels de la petite teigne de la ruche (Achroia grisella). Chez cette pyrale les mâles se regroupent en leks, produisent un chant d'appel ultrasonique intense et les femelles choisissent un partenaire sexuel en se basant sur des caractéristiques acoustiques spécifiques de ce chant. Cependant les signaux sexuels ultrasoniques des mâles peuvent également attirer des prédateurs : les chauves-souris insectivores. Ainsi, au sein des leks, les sélections sexuelle et de viabilité jouent et peuvent modeler (1) l'évolution du choix des femelles, (2) le maintien et l'évolution du lek, (3) l'origine de la communication acoustique sexuelle. Les travaux conduits durant cette thèse soulignent l'intérêt de l'étude du jeu des sélections sexuelle et de viabilité pour comprendre comment la sélection naturelle peut modeler l'origine, l'évolution et le maintien des traits sexuels. Les résultats indiquent en particulier le rôle crucial de la pression de prédation dans ces processus sélectifs
Rôle de l'antigène O dans la reconnaissance d'Escherichia coli par les cellules épithéliales mammaires bovines et modulation par le CD14 soluble by Mégane Védrine( )

1 edition published in 2019 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

Mastitis constitute the main source of financial losses for dairy herds in France and worldwide. Among major mastitis pathogens Escherichia coli (E. coli) is of great importance, especially in acute clinical mastitis. The role of host factors in the ability to eliminate the causative pathogen is well-known, but the implication of bacterial characteristics in the severity of the infection is more difficult to establish. This study aimed at deciphering the bacterial factors involved in the interactions between E. coli and the mammary gland, and in particular the recognition of E. coli by bovine mammary epithelial cells (MEC), which constitute one of the first defense lines of the mammary gland
Perception de la voix humaine et hallucinations auditives : étude clinique et neurophysiologique by Jérôme Graux( )

1 edition published in 2012 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

The hypothesis of this study was that schizophrenic patients with auditory verbal hallucinations perceive their own voices as alien voices. The aim of the study was to investigate the electrophysiological responses evoked by participants'own voices and those of unknown individuals. Our results in healthy subjects showed that they allocated fever automatic attentional resources to their own voices than to unfamiliar voices. This attenuation effect of the automatic orientation of attention to own voice was not observed in schizophrenic patients. In addition, in agreement with our initial hypothesis, the attenuation decreased even further as the hallucinations became more severe
Etude de l'expression d'une transposase domestiquée : SETMAR by Audrey Montagne( )

1 edition published in 2015 in French and held by 1 WorldCat member library worldwide

SETMAR est un gène chimérique constitué d'un domaine SET (codant des fonctions d'histone méthylase) et du domaine MAR (ayant conservé certaines fonctions de la transposase HsMAR1). Des études ont montré que les deux domaines sont biologiquement actifs et sont impliqués dans la stabilité et/ou dans la régulation de l'expression du génome humain. La littérature suggère que l'expression de SETMAR est plus forte dans les cellules cancéreuses que dans les cellules saines. Notre hypothèse de travail est que la protéine SETMAR est surexprimée en conditions pathologiques, permettant aux cellules de franchir les points de contrôle du cycle cellulaire, contribuant ainsi à augmenter l'instabilité génétique. Notre objectif est d'étudier la régulation de l'expression de SETMAR et son implication dans l'oncogenèse, gliale en particulier
 
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École doctorale de Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Orléans-Tours)

École doctorale de Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Tours-Orléans)

École doctorale SSBCV (Centre-Val de Loire)

ED 549 (Centre-Val de Loire)

ED SSBCV (Centre-Val de Loire)

ED549 (Centre-Val de Loire)

Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant

SSBCV (Centre-Val de Loire)

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