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Khelif, Mohamed Khaled (1978- ...).

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Works: 2 works in 4 publications in 2 languages and 16 library holdings
Roles: Editor, Author
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Most widely held works by Mohamed Khaled Khelif
Des sources ouvertes au web de données( Book )

2 editions published in 2014 in French and English and held by 14 WorldCat member libraries worldwide

Web sémantique et mémoire d'expériences pour l'analyse du transcriptome by Mohamed Khaled Khelif( Book )

2 editions published in 2006 in French and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Cette thèse rentre dans le cadre du projet MEAT (Mémoire d'Expériences pour l'Analyse du Transcriptome) dont le but est d'assister les biologistes travaillant dans le domaine des puces à ADN, pour l'interprétation et la validation de leurs résultats. Nous proposons une aide méthodologique et logicielle pour construire une mémoire d'expériences pour ce domaine. Notre approche, basée sur les technologies du web sémantique, repose sur l'utilisation des ontologies et des annotations sémantiques sur des articles scientifiques et d'autres sources de connaissances du domaine. Dans une première partie, nous proposons une ontologie modulaire pour la description des connaissances du domaine des puces à ADN (base de données d'expériences, articles scientifiques, entités biomédicales...). Cette ontologie intègre entre autres, l'ontologie déjà existante UMLS, ce qui nous a permis d'approfondir le problème de réutilisation d'ontologies et leur adaptation à une nouvelle application. Ensuite, nous proposons une méthodologie générique pour la génération d'annotations sémantiques basées sur cette ontologie en exploitant les connaissances contenues dans les textes. Cette méthodologie a l'originalité d'utiliser des techniques de traitement automatique de la langue et des grammaires d'extraction de relations pour extraire automatiquement des articles scientifiques les relations reliant des termes d'UMLS reconnus dans le texte. Un système supportant cette méthodologie a été implémenté et validé par nos collègues biologistes. Enfin, pour faciliter la diffusion des connaissances contenues dans la mémoire, nous proposons un prototype qui se base sur un moteur de recherche sémantique (Corese) et qui exploite la base d'annotations que nous avons constituée. Cette partie du travail a permis d'améliorer la tâche de recherche d'informations en la rendant plus efficace et en offrant des mécanismes de raisonnement sur les connaissances du domaine
 
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