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Ocaña i Rebull, Jordi

Overview
Works: 37 works in 56 publications in 3 languages and 80 library holdings
Roles: Author, Contributor
Classifications: QH323.5, 572.86
Publication Timeline
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Most widely held works by Jordi Ocaña i Rebull
Fundamentos de probabilidad en bioestadística by G Alonso( Book )

7 editions published between 1976 and 1989 in Spanish and held by 28 WorldCat member libraries worldwide

Models matemàtics i de simulació del polimorfisme cromosòmic produit per inversions by Jordi Ocaña Rebull( Book )

4 editions published between 1981 and 2008 in Catalan and Spanish and held by 4 WorldCat member libraries worldwide

Models de competència en medis compartimentats : una aportació a la metodologia de la simulació by Roderic Guigó( )

2 editions published between 1988 and 1991 in Catalan and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

Optimización en estudios de Monte Carlo en estadística aplicaciones al contraste de hipótesis by Esteban Vegas Lozano( Book )

3 editions published between 1996 and 2009 in Spanish and held by 3 WorldCat member libraries worldwide

An equivalence approach to the integrative analysis of feature lists by Alex Sánchez-Pla( )

1 edition published in 2019 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Statistical methods for the modeling of label-free shotgun proteomic data in cell line biomaker discovery = Mètodes estadístics pel modelat de dades de proteòmica sense marcatge, en descobriment de biomarcadors sobre línies cel·lulars by Josep Gregori Font( Book )

2 editions published in 2014 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

En la tesi s'ha desenvolupat, dissenyat i implementat una solució per l'anàlisi de dades de proteòmica comparativa en descobriment de biomarcadors. Específicament la solució s'ha optimitzat per l'anàlisi de secretomes de línies cel·lulars tumorals per LC-MS/MS sense marcatge, i quantificant pel nombre d'espectres de pèptids assignats a cada proteïna. Durant el desenvolupament de la metodologia s'ha demostrat la incidència i rellevància dels efectes batch en l'anàlisi comparatiu de pèptits sense marcar per LC-MS/MS. Així com les característiques que identifiquen un potencial biomarcador com a reproductible. Els models s'han desenvolupat amb l'ajut de dades empíriques obtingudes de mostres amb mescles controlades de proteïnes, i de simulacions. La solució informàtica que implementa el model desenvolupat consta de dos paquets R/Bioconductor, amb les respectives interfícies gràfiques que faciliten el seu ús a no experts. El primer paquet, msmsEDA, consta de funcions útils en l'anàlisi exploratòria de dades, i permet avaluar la qualitat del conjunt de dades d'un experiment de LC-MS/MS basat en comptatge d'espectres, així com explorar l'eventual presència de valors extrems, factors de confusió, o d'efectes batch. El segon paquet, msmsTests, encapsula funcions per la inferència en el descobriment de biomarcadors. El model emprat és un GLM que contempla la inclusió de factors per blocs per la correcció d'efectes batch, i incorpora una normalització generalitzada per offsets que permet la comparació de secretoma al nivell d'una cel·lula. Les distribucions implementades són la de Poisson i la binomial negativa, així com l'extensió de la quasiversemblança. En conjut el model desenvolupat i la implementació informàtica que se'n ha fet permet: ·Avaluar la qualitat d'un conjunt de dades de LC-MS/MS. ·Identificar valors extrems. ·Identificar la presència de factors de confusió o d'efectes batch. ·El descobriment de biomarcadors emprant la distribució que millor s'ajusti a les dades. ·Assegurar un bon nivell de reproductibilitat mercès a un filtre post-test. Els paquets i llur documentació es troben lliurement disponibles a bioconductor.org, i les interfícies gràfiques a github.com
Análisis de procedimientos para la evaluación de medicamentos : bioequivalencia y farmacogenética by María Pilar Sánchez Olavarría( Book )

2 editions published between 2009 and 2010 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Técnicas inferenciales basadas en índices de diversidad by Sergi Vives Civit( Book )

2 editions published in 1997 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Bioequivalencia promedio escalada by Joel Alejandro Muñoz Gutiérrez( Book )

2 editions published in 2017 in Spanish and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

"La agencia europea del medicamento, EMA, y la estadounidense FDA, propusieron límites de bioequivalencia (BE) "escalada" para facilitar la declaración BE de genéricos de drogas de alta variabilidad (HVD). La determinación de la BE para una (HVD) fue una cuestión ampliamente debatida en los años finales del siglo XX y la primera década del siglo XXI (p.e. Shah et al. 1996, Tothfalusi et al, 2001, Tothfalusi et al. 2003). A principios de la presente década, tanto la EMA como la FDA presentaron regulaciones, que se basan en criterios escalados, sobre HVD. Ambos enfoques entran dentro de lo que se denomina bioequivalencia promedio escalada (Scaled Average Bioequivalence, SABE). Estos límites de BE se definen en función de la variabilidad intrasujeto de la formulación de referencia. Cabe mencionar, que cada uno de estos métodos presentan ciertas objeciones, por ejemplo: estas funciones son poco regulares, discontinuas en el método FDA y además el test de BE asociados al método de EMA aplica de forma incorrecta el principio de inclusión de intervalos (CIIP) ya que se utiliza sobre límites aleatorios y no constantes prefijadas que son los que se debeŕıan utilizar en el CIIP, y por lo tanto, todos estos métodos mencionados tienen problemas de control del error de tipo I. En esta memoria se proponen mejoras en las metodoloǵıas de ambas agencias reguladoras y un ajuste de nivel de significación. Las alternativas que se mencionan son utilizar variantes continuas del enfoque FDA, y en el caso de la EMA, es usar el método Howe para aplicar el principio de inclusión de intervalos sobre límites constantes. Otra mejora que se propone aquí es utilizar límites regulares que fueron mencionados por los autores Karalis et al. 2011 y Kytariolos, J. et al. 2006, en el enfoque EMA (Karalis et al. 2011), que se basan en la función Sigmoidea. Estos autores utilizan métodos empíricos para estimar los parámetros que emulan los límites lineales de la EMA. Por otra parte, otra propuesta en esta memoria es aplicar el método Howe a estos límites regulares y observar si hay más control con el error de tipo I. Finalmente, otro enfoque que se expone es corregir el sesgo de algunas estadísticas que se aplican con el método Howe sobre límites más regulares. Entre los métodos propuestos "ContFDA", "ContFDA2" y "HoweEMA", mejoran los resultados al considerar el método de ajuste del nivel de significancia, ya que son los que menor pérdida de potencia presentan logrando obtener métodos estadísticamente válidos. Queda como futuro trabajo ver qué se obtendría con el método "bcHoweLO" (corregido por el sesgo) pues como se puede ver en los resultados, al aplicar este método pero sin ajustar el nivel de significancia, presenta un mejor control del error de tipo I aunque persiste cierta oscilación en el mismo. Por lo tanto, se esperaría que este método proporciona un test estadísticamente válido con un menor grado de pérdida de la potencia. En todas estas propuestas se utilizan como métodos de estimación de parámetros el enfoque de contraste intrasujeto (ISC), excepto para la EMA, que se debe utilizar el ajuste ANOVA en la estimación de parámetros cuyo enfoque de estimación queda como tema futuro en esta memoria. Además se realizan dos packages de R simcrossover y adjustalpha las que contienen las funciones simCrossover y adjAlpha. La primera función simula datos de un diseño crossover dado un modelo lineal que se le indique, y la segunda, realiza un ajuste del nivel de significancia en un test de bioequivalencia promedio escalada de referencia (RSABE) que se basa en datos de un diseño crossover con el objetivo de controlar su error de tipo I." -- TDX
Nonlinear mixed-effects models and nonparametric inference : a method based on bootstrap for the analysis of non-normal repeated measures data in biostatistical practice by Rachid El Halimi( Book )

2 editions published in 2005 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Empirical study of correlated survival times for recurrent events with proportional hazards margins and the effect of correlation and censoring by Rodrigo Villegas( )

1 edition published in 2013 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Optimización de los ensayos clínicos de fármacos mediante simulación de eventos discretos, su modelización, validación, verificación y la mejora de la calidad de sus datos by Toni Monleón Getino( )

2 editions published between 2005 and 2006 in Catalan and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Comparison of lists of genes based on functional profiles by Miquel Salicrú( )

1 edition published in 2011 in English and held by 2 WorldCat member libraries worldwide

Distances between populations of Drosophila subobscura, based on chromosome arrangement frequencies by Antoni Prevosti Pelegrín( Book )

1 edition published in 1975 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Bootstrapping repeated measures data in a nonlinear mixed-models context by Jordi Ocaña( Book )

1 edition published in 2005 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Variance reduction in the study of a new test concerning the Behrens-Fischer problem by Esteban Vegas( Book )

1 edition published in 1997 in English and held by 1 WorldCat member library worldwide

Simulació de polimorfismes cromosòmics segons l'estructura del medi i el tipus de selecció by Roderic Guigó i Serra( )

1 edition published in 1983 in Catalan and held by 1 WorldCat member library worldwide

Lnvestigación comparativa de la eficiencia (COMER) metanálisis de estudios coste-efectividad sobre distribuciones cópulas by Carlos Crespo( )

1 edition published in 2015 in Spanish and held by 1 WorldCat member library worldwide

La evaluación económica de tecnologías sanitarias supone un conjunto de herramientas que tienen como finalidad examinar las consecuencias que tiene, en el corto y largo plazo, la utilización de las tecnologías sanitarias en los individuos y en la sociedad en su conjunto. Puesto que existen múltiples alternativas donde asignar dichos recursos, la evaluación económica trata de poner al alcance de los decisores del ámbito sanitario aquella información relevante desde el punto de vista de la eficiencia. Es por ello que la estadística se ha convertido en una pieza clave cada vez más necesaria para mejorar y desarrollar nuevos métodos para la evaluación económica. Actualmente las revisiones sistemáticas y su metanálisis de estudios de evaluación económica consisten en una descripción narrativa de los estudios realizando sólo el metanálisis de cada uno de sus componentes y obviando la relación existente entre costes y efectos. En esta tesis se ha desarrollado un nuevo método para llevar a cabo el metanálisis de estudios coste-efectividad, bautizándolo como COMER (del inglés, Comparative Eficiency Research). El metanálisis propuesto consiste en la estimación del beneficio monetario neto incremental total (TINB), ponderación de los beneficios monetarios netos incremental (INB) de cada estudio a partir de la inversa de la varianza. Para validar el método se estudió cómo incorporar la estructura de dependencia entre costes y efectos mediante las distribuciones cópulas. De tal forma que se simuló la distribución Frank Copula con dependencia positiva donde se asoció a las distribuciones marginales la distribución lognormal para costes y la distribución gamma para desutilidades. Se crearon cohortes hipotéticas variando el tamaño muestral y asumiendo tres escenarios con todas las combinaciones posibles: alternativa coste-efectiva, alternativa no coste-efectiva y alternativa dominante. Se comparó el resultado del COMER con resultado teórico en función del ratio coste-efectividad incremental y el INB, asumiendo un margen de error de 2.000 y 500 unidades monetarias, respectivamente. Adicionalmente, se estimó cual sería el tamaño muestral mínimo para poder obtener mediante COMER una estimación ajustada con un probabilidad alta (>70%). También se evaluó en qué medida el tamaño muestral permite alcanzar la convergencia a la [tau] de Kendall original. Para poder aplicarse esta aproximación del metanálisis mediante el TINB será necesario que en las evaluaciones económicas futuras se incorpore como resultado la matriz de covarianzas de la diferencia de costes y efectos. En el capítulo 1 de la tesis se hace una revisión de los conceptos de evaluación económica ahondando en qué métodos estadísticos se aplican en cada caso, así como cuál es el uso de los metanálsis. En este mismo capítulo se describen la teoría subyacente en las distribuciones cópulas y la utilización residual en el ámbito de la evaluación económica. En el capítulo 2 se indican tanto el objetivo general como los objetivos específicos de estudiar como incorporar la simulación a nivel de paciente en un estudio coste-efectividad de microsimulación y como incorporar la estructura de correlación en las simulaciones basado en regresiones. En el capítulo 3 se incluyen los informes de los directores de la tesis para los cuatro artículos incluidos en la misma. En el capítulo 4 se realiza la discusión de los cuatro artículos, profundizando en el método COMER. Los artículos propiamente se pueden localizar en el capítulo 6, así como un resumen de los mismos. Se han incorporado dos apéndices con el código en R que permiten ejecutar el método
El lenguaje de simulación Ecogen manual preliminar by Jordi Ocaña( Book )

1 edition published in 1986 in Spanish and held by 1 WorldCat member library worldwide

Estudi d'alguns problemes estadístics de la distància genètica de Prevosti : modelització orientada a objectes en estadística i simulació by Àlex Sànchez( )

1 edition published in 1996 in Catalan and held by 1 WorldCat member library worldwide

 
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Jordi Ocaña wetenschapper

Ocaña, J.

Ocaña, Jordi

Ocaña Rebull, J.

Ocaña Rebull, Jordi

Languages
Spanish (19)

English (10)

Catalan (9)